C#景深融合
最近因為一個項目要求,將matlab寫的一些關於圖像的算法轉成C#。這個挺坑爹的,C#處理圖像還是挺少的,opencv關於這方面的資源挺少的。我用的是opencvsharp這個第三方庫,GitHub上有資源。
這個景深融合其實是一個顯微鏡掃描成像的問題,一共有數張圖像,都是局部清晰,其它部分模糊。比如下面這樣:
實際處理思路是:圖像邊緣檢測,然后做了一個平滑處理,根據灰度圖的亮度進行篩選,形成一個分區。最后根據分區處理像素的填充。
下面貼代碼:
讀取圖片的操作就略去了,邊緣提取用的是sobel,注意一下,opencvsharp中的圖像處理注意mat數據的溢出。及時調整mat的像素深度比如16s,通常原始圖像讀取是8u。像素深度關系到具體坐標的數據格式。
1 class Oper 2 { 3 public static Mat Deal(Mat ImIn) 4 { 5 Mat mat_gray = new Mat(); 6 //
7 //Mat smooth_img = new Mat(); 8 //Cv2.GaussianBlur(ImIn, smooth_img, new OpenCvSharp.Size(3, 3), 0.96, 0.96, BorderTypes.Default); 9 //灰度圖
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12 Cv2.CvtColor(ImIn, mat_gray, ColorConversionCodes.BGR2GRAY); 13 //GetMatData.Arr(mat_gray);
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15 Mat X = new Mat(); Mat Y = new Mat(); 16 //InputArray arr = InputArray.Create<float>(new float[3, 3] { { -1, -2, -1 }, { 0, 0, 0 }, { 1, 2, 1 } }); 17 //Cv2.Filter2D(mat_gray,X , -1, arr, new Point(-1, -1), 0); 18 //InputArray arr_convert = InputArray.Create<float>(new float[3, 3] { { -1, 0, -1 }, { -2, 0, 2 }, { -1, 0, 1 } }); 19 //Cv2.Filter2D(mat_gray, Y, -1, arr, new Point(-1, -1), 0); 20
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22 //sobel邊緣 23 //-----------這里開始轉變為16位運算-------------
24 Cv2.Sobel(mat_gray, X, MatType.CV_16S, 1, 0, 3,1,0,BorderTypes.Replicate); 25 Cv2.Sobel(mat_gray, Y, MatType.CV_16S, 0, 1, 3,1,0,BorderTypes.Replicate); 26 //GetMatData.getData(X); 27 //GetMatData.getData(Y);
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29 int width = X.Cols; int heigth = Y.Rows; 30 //-------double型數據的對應像素深度是64F---------
31 var output = new Mat(X.Size(),MatType.CV_64F); 32
33 var indexer_x = X.GetGenericIndexer<Int16>(); 34 var indexer_y = Y.GetGenericIndexer<Int16>(); 35 var indexer_op = output.GetGenericIndexer<double>(); 36 //算術平均
37 for (int index = 0; index < heigth ; index++) 38 { 39 for (int index_y = 0; index_y < width; index_y++) 40 { 41 Int16 Gx = indexer_x[index,index_y]; 42 Int16 Gy = indexer_y[index,index_y]; 43
44 double v1 = Math.Pow(Gx, 2); 45 double v2 = Math.Pow(Gy, 2); 46 double val = Math.Sqrt(v1 + v2); 47
48 indexer_op[index, index_y] = val; 49 } 50 } 51 //var ss =indexer_op[0, 0];
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53 Cv2.GaussianBlur(output,output,new OpenCvSharp.Size(31,31),11); 54 //Cv2.ImShow("te", output); Cv2.WaitKey(0);
55 return output; 56 } 57
58 }
到這里基本完成了圖像的局部提取,下面進行一下分區的對比提取。
這部分我是這樣理解的,比如十張局部掃描圖,根據像素的梯度變化可以將清晰處與模糊處區分開來,sobel可以很好的將邊緣提取出來,經過平滑處理形成分區。
之后十張圖相當於MN10 的矩陣,根據像素的梯度變化,每個像素取最大值可以准確提取這部分圖像的清晰部分。(這里一個理解是實際上清晰部分的梯度變化較模糊處大,梯度值實際上可以表現為亮度的大小)
像素對比處代碼如下:
1 public static Mat id_Mat (Mat[]coll) 2 { 3 int heigth = coll[0].Rows; 4 int width = coll[0].Cols; 5
6 Mat max_id = new Mat(coll[0].Size(),MatType.CV_8U); 7 var indexer_id = max_id.GetGenericIndexer<byte>(); 8 //int ss = max_id.At<double>(10, 10); 9 //
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12 //注意像素深度的設置,數據格式的統一
13 Mat mat1 = coll[0]; 14 var indexer_pre=mat1.GetGenericIndexer<double>(); 15 for (int num = 1; num < coll.Length; num++) 16 { 17 var mat2 = coll[num]; 18 var indexer = mat2.GetGenericIndexer<double>(); 19 for (int index = 0; index < heigth ; index++) 20 { 21 for (int index_y = 0; index_y < width; index_y++) 22 { 23 double G1 = indexer_pre[index,index_y]; 24 double G2 = indexer[index, index_y]; 25 if (G1 <= G2) 26 { 27 double G_double = (double)G2; 28 indexer_pre[index, index_y] = G_double; 29 indexer_id[index, index_y] = (byte)num; 30 } 31 } 32 } 33 } 34 return max_id; 35 }
一點說明,這里為了后續圖像合成的方便,輸出mat max_id實際是每個像素選取的最大值所屬的圖像編號。
比如這樣的:
1 | 2 |
---|---|
1 | 2 |
左上的像素取圖片1中對應像素的值。
最后就是填像素值合成了,如下:
1 class Merge 2 { //ID點陣選擇相應ID圖像填色
3 public static Mat ImMerge(Mat IDIm,Mat[]Coll_Ori) 4 { 5 Mat ImMer = new Mat(Coll_Ori[0].Size(), Coll_Ori[0].Type()); 6 var indexer_mer=ImMer.GetGenericIndexer<Vec3b>(); 7 var indexer_id = IDIm.GetGenericIndexer<byte>(); 8
9 int heigth = IDIm.Rows; int width = IDIm.Cols; 10 for (int index=0;index<Coll_Ori.Length;index++) 11 { 12 for (int x = 0; x < heigth; x++) 13 { 14 for (int y = 0; y < width; y++) 15 { 16 int val_ID = indexer_id[x, y]; 17 if (val_ID == index) 18 { 19 var Ori_indexer = Coll_Ori[index].GetGenericIndexer<Vec3b>(); 20 indexer_mer[x, y] = Ori_indexer[x, y]; 21 } 22 else { continue; } 23 } 24 } 25 } 26 return ImMer; 27 } 28 }
最后的輸出圖像如下:
例子1,圖有點大,截個屏吧!
例子2
總的來說算法的處理效果是不錯的,速度上也可以,畢竟C#還是不太適合做算法。我看網上基於C#的這方面代碼還沒有,希望對大家有一定的價值!