lammps--命令注意


1.create_box  這個關鍵字看似簡單實則讓人難受。

  ①在寫這個關鍵字的時候切記:一一對應原則,即:

    bond/types  對應  extra/bond/per/atom

    angle/types  對應  extra/angle/per/atom

    dihedral/types  對應  extra/dihedral/per/atom

    improper/types  對應  extra/improper/per/atom

  當第一列關鍵字被用到的時候,第二列緊隨其后加進來,不然就會報錯:Molecule auto special bond generation overflow (../molecule.cpp:1142)

  ②必寫關鍵字:extra/improper/per/atom

    該關鍵字必須寫,否則報錯:同上。該關鍵字系數必須 >= 所建粒子(分子)中原子的個數

2.create_atoms  該關鍵字沒什么太難的,注意一點:

  seed = random # seed 即正整數,並不是讓選擇random/seed (這個錯誤讓我尷尬)。

3. Tdamp、Pdamp  如何快速確定

  一般  timestep×100  即為該值。

4. 混合勢函數書寫

  書寫混合勢函數時,用pari_style hybrid 關鍵字,將要用到的勢函數全部列出即可,然后再pair_coeff 中定義勢函數。

  某段勢函數值相同時:pair_coeff: pair_coeff 9*10 9*10 XXXX

  所有勢函數值相同時:pair_coeff: pair_coeff * * XXX

 


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