FSL是在服務器上安裝的，可能有點問題，但是預處理部分還是沒問題的，記錄一下操作流程。
由於我拿到的數據格式就是NIfTI格式的，所以不需要做格式轉換。
使用數據格式介紹：
四維NIfTI文件：.nii,即轉換后的腦圖像；
b值文件：bvals，記錄掃描磁場加權的數值信息；
b向量文件：bvecs，記錄掃描磁場加權的方向信息。
以及對應的T1加權結構像。
預處理操作：
1.去除非腦組織。對T1和DTI分別進行。
去除非腦組織前，需要先從被試的四維文件中提取出一張未加權的圖像，也就是b0圖像，然后對b0進行bet處理。在原始的NIfTI文件中，第一張圖片即為未加權的圖像，使用的命令如下：
fslroi input nodif 0 1
其中fslroi函數將待選擇的圖像從原始四維文件中分離出來。指令中input是NIfTI文件，nodif是輸出，即未加權的圖像。0表示從第一張圖像開始提取，1表示只取一張圖像。
去除非腦組織的命令如下：
bet nodif.nii.gz nodif_brain -m -f 0.3 -g -0.3
其中bet函數實現去除腦組織。-o用於觀察去除頭蓋骨的程度是否合理，-m用於生成mask文件，該文件用於后續的概率建模，-f用於去除頭蓋骨，參數可以調整，-g用來去除脖頸及以下部分。
2.渦流校正：
使用的命令如下：
eddy_correct input data 0
input為格式轉換后的NIfTI格式文件，data是渦流校正后的文件。0表示以第一張作為參考圖像，即未加權的圖像。
參考資料：
1.https://blog.csdn.net/zaza_zaza/article/details/46459987
2.基於DTI腦網絡多變量分析的面孔識別能力個體差異的研究_孫凱