關於缺失值(missing value)的處理
在sklearn的preprocessing包中包含了對數據集中缺失值的處理,主要是應用Imputer類進行處理。
首先需要說明的是,numpy的數組中可以使用np.nan/np.NaN(Not A Number)來代替缺失值,對於數組中是否存在nan可以使用np.isnan()來判定。
使用type(np.nan)或者type(np.NaN)可以發現改值其實屬於float類型,代碼如下:
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>>>
type
(np.NaN)
<
type
'float'
>
>>>
type
(np.nan)
<
type
'float'
>
>>> np.NaN
nan
>>> np.nan
nan
|
因此,如果要進行處理的數據集中包含缺失值一般步驟如下:
1、使用字符串'nan'來代替數據集中的缺失值;
2、將該數據集轉換為浮點型便可以得到包含np.nan的數據集;
3、使用sklearn.preprocessing.Imputer類來處理使用np.nan對缺失值進行編碼過的數據集。
代碼如下:
1
2
3
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8
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10
|
>>>
from
sklearn.preprocessing
import
Imputer
>>> imp
=
Imputer(missing_values
=
'NaN'
, strategy
=
'mean'
, axis
=
0
)
>>> X
=
np.array([[
1
,
2
], [np.nan,
3
], [
7
,
6
]])
>>> Y
=
[[np.nan,
2
], [
6
, np.nan], [
7
,
6
]]
>>> imp.fit(X)
Imputer(axis
=
0
, copy
=
True
, missing_values
=
'NaN'
, strategy
=
'mean'
, verbose
=
0
)
>>> imp.transform(Y)
array([[
4.
,
2.
],
[
6.
,
3.66666667
],
[
7.
,
6.
]])
|
上述代碼使用數組X去“訓練”一個Imputer類,然后用該類的對象去處理數組Y中的缺失值,缺失值的處理方式是使用X中的均值(axis=0表示按列進行)代替Y中的缺失值。
當然也可以使用imp對象來對X數組本身進行處理。
通常,我們的數據都保存在文件中,也不一定都是Numpy數組生成的,因此缺失值可能不一定是使用nan來編碼的,對於這種情況可以參考以下代碼:
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>>> line
=
'1,?'
>>> line
=
line.replace(
',?'
,
',nan'
)
>>> line
'1,nan'
>>> Z
=
line.split(
','
)
>>> Z
[
'1'
,
'nan'
]
>>> Z
=
np.array(Z,dtype
=
float
)
>>> Z
array([
1.
, nan])
>>> imp.transform(Z)
array([[
1.
,
3.66666667
]])
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上述代碼line模擬從文件中讀取出來的一行數據,使用nan來代替原始數據中的缺失值編碼,將其轉換為浮點型,然后使用X中的均值填補Z中的缺失值。