前言
在工業界，天天做着重復的簡單工作，已失去了對領域新技術發展的敏感性和好奇心，對技術人員來說這是件可怕的事情。因為沒時間，也沒興趣看文獻，不能掌握第一手資料，只能在網上找找已有的信息，隨便翻翻大佬的博客，看看人家在做什么。這樣也能稍稍了解行業動態，有助於對知識的思考和業務水平的提升。
工具包
Bioconductor workflow：
關於蛋白組的內容並不多，目前只有proteomics這一個workflow。我暫時還沒用過。
https://www.bioconductor.org/packages/release/workflows/html/proteomics.html
Github：
Github上topics以mass-spectrometry為關鍵詞搜索結果（按標星排序）：
https://github.com/topics/mass-spectrometry
以proteomics為關鍵詞搜索結果：
https://github.com/topics/proteomics
有一個RforProteomics的R包專用統計了蛋白質組學數據分析的包，並進行可視化展示。
可以看出，相比於基因組學，蛋白組和代謝組流行的包實在太少了。后期我會從中選擇幾個感興趣的工具試用下，如果好用再學習源碼。
大佬Lab
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瑞士蘇黎世聯邦理工大學（ETH）Ruedi Aebersold團隊
https://imsb.ethz.ch/research/aebersold.html
看看他們發的文章、軟件，里面還有不少東西可挖，比如DIA視頻課程：http://dia-swath-course.ethz.ch/videos.html -
德國馬普研究所Matthias Mann團隊
https://www.biochem.mpg.de/en/rd/mann
https://www.cpr.ku.dk/research/proteomics/mann-group/ -
德國馬普研究所Juergen Cox團隊
https://www.biochem.mpg.de/en/rg/cox
因MaxQuant和Perseus有名。 -
比利時根特大學系統生物學團隊（Computational Omics and Systems Biology Group）
這個團隊生信很強，開發了不少軟件，其中包括宏蛋白組學的研究。
https://www.compomics.com/ -
中國科學院pFind團隊
https://github.com/pFindStudio
http://pfind.ict.ac.cn/
p系列軟件開發。 -
美國貝勒醫學院章冰團隊
http://www.zhang-lab.org/
https://github.com/bzhanglab -
耶魯大學劉延盛團隊
https://www.yslproteomics.org/ -
西湖大學郭天南團隊
http://www.guomics.com/
會議
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中國計算蛋白質組學研討會（CNCP）
http://cncp.ict.ac.cn/2018/index.html
中國計算蛋白質組學會議是pFind團隊主辦的小型會議，算是集結了中國蛋白組生信力量。從2010年開始，會議每兩年舉辦一次，目前已舉辦了五屆。稍微看了下往屆的安排、主題、內容和文化，感覺挺好的。希望今年有機會參加上海的會議。里面有部分公開的視頻和課件，雖然是幾年前的東西，感覺還不過時（可能是質譜技術發展受限的緣故吧），可挑取自己感興趣的內容，仔細看看，收獲會有不少。 -
國際蛋白質組學大會，HUPO（Human Proteome Organisation）
https://hupo.org/
歷屆會議資料：https://hupo.org/HUPO-Congresses
偏學術。看看就行，不評價。 -
中國蛋白質組學大會，CNHUPO（China Human Proteome Organization）
偏科研應用，貌似沒官網。 -
美國質譜學會，ASMS（American Society for Mass Spectrometry）
https://asms.org
歷屆會議資料：https://www.asms.org/conferences/annual-conference/past-annual-conferences
偏應用。看看就行，不評價。
后記
以上列出的只是一個引子，真正想了解內容還是需要自己去深挖，找到某個感興趣的工具或問題，不斷延展學習。切勿收藏不看。