原文:蛋白組學生物信息資源列表

前言 在工業界,天天做着重復的簡單工作,已失去了對領域新技術發展的敏感性和好奇心,對技術人員來說這是件可怕的事情。因為沒時間,也沒興趣看文獻,不能掌握第一手資料,只能在網上找找已有的信息,隨便翻翻大佬的博客,看看人家在做什么。這樣也能稍稍了解行業動態,有助於對知識的思考和業務水平的提升。 工具包 Bioconductor workflow: 關於蛋白組的內容並不多,目前只有proteomics這一 ...

2020-01-13 23:31 0 1199 推薦指數:

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蛋白組學之外泌體

1. 外泌體研究背景: 胞外囊泡是從細胞膜上脫落或者由細胞分泌的具有雙層膜結構的囊泡狀小體,主要由微囊泡、凋亡小體、外泌體組成。而外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18 g/ml,可攜帶核酸、蛋白質質和脂質等,存在於血液、唾液、尿液等多種體液中 ...

Thu Mar 26 19:09:00 CST 2020 0 999
蛋白組學定量值得比較說明

1. Maxquant的iBAQ和LFQ,該用哪個?我們使用Maxquant做Label Free蛋白學定量分析的時候,在Maxquant的參數設置時,會遇到兩個參數,LFQ和iBAQ,那么,選擇哪個好呢?如果你都選上,在最終的proteingroups.txt中,會出現三列 ...

Mon Oct 21 21:04:00 CST 2019 0 1368
蛋白組DIA分析:Spectronaut軟件使用指南

官方文檔: https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 准備 Spectronaut軟件是蛋白組DIA分析最常用的譜圖解析軟件之一,優點是定量准確,缺點是高額收費,window版本,速度慢。一起來簡單了解下用法 ...

Fri Mar 13 00:11:00 CST 2020 0 2064
信息資源管理---已過筆記

一、信息資源管理相關概念 1. 信息是事物運動的狀態以及它的狀態改變的方式。它既不是物質,也不是能量,而是一個與物質和能量既有聯系又有區別的新概念。分為本體論和認識論信息。有為主體消除或減少某種不確定性。 2. 信息的分類: (1)信息的產生和作用機制划分:自然信息和社會信息。(2)感知 ...

Tue Aug 31 22:08:00 CST 2021 0 398
學生信——生物基本概念

1、ORF:開放閱讀框,開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列,不能被終止子打斷。從起始密碼子開始,到終止密碼子結束。前面是5‘UTR, 后面是3’UTR,ORF一般是針對mRNA來說的。 mRNA由基因序列轉錄得來,一個基因可能有幾條不同的轉錄本,因而對 ...

Tue Jun 01 19:12:00 CST 2021 1 2020
生物信息 perl 腳本實戰

索引 1.統計fasta、fa和fastq文件的長度,統計fastq的reads個數,單個reads長度,reads總長度;統計fasta文件中contig的個數,列出名稱,單條的長度,以及總長 ...

Fri Aug 12 00:17:00 CST 2016 0 3716
 
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