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6天前，BMC Genomics 推了一篇文獻“Population history and genetic adaptation of the Fulani nomads: inferences from genome-wide data and the lactase persistence trait”。
要不是這個標題起的太大，又是Population history，又是 genetic adaptation ，我可能都不會點開來看。
但是既然看了，還是要寫點總結，畢竟，每一篇能發出來的文章，總是有那么一點值得我們借鑒的。
這篇文章很聰明的一點是，他避開了GWAS沒信號這個問題，轉而將重點放在：結合表型和人群歷史以及遺傳適應性來講。
下面講講整篇文章的研究思路。
0. 研究背景
Fulani nomads是在非洲西部的一群游牧民族。
游牧民族最大的特點是什么。當然是（牛/羊）奶多。
所以乳糖耐性就是一個明顯受到選擇的表型。
這也是他們本次研究采用乳糖耐性作為表型的原因。
講完背景，我們接下來看看他們做了什么工作。
1. 研究的人群的歷史。
62個樣本，講人群歷史當然很干巴巴。
那么，就需要增大樣本量了。
增大樣本量，首選就是千人基因組公共數據庫了。 全世界各個群體的基因型數據都有，不嫖白不嫖。
這張圖用的是EIGENSOFT 做PCA分析，ADMIXTURE推斷人群結構。
2.祖先特異性推斷
對之前文獻發表的乳糖耐性相關變異位點進行祖先特異性推斷。
乳糖耐性相關的基因周圍的位點多樣性降低了，這表明乳糖耐性在這個群體是受到強烈的選擇。
3.Fulani人群與乳糖耐性相關的顯著位點分析
這一步就是用的GWAS分析。
當然，62個樣本，找不到信號也很正常。
因此，作者還結合了Fulani人群的iHS值和XPEHH值，放在一起和GWAS找出來的最高信號一起討論。
這么一結合，文章的檔次就提升了。
4.結束語
各位找不到GWAS信號的同行，也不用太灰心。
畢竟GWAS只是找遺傳位點的一個方法而已，可我們的研究內容不只找遺傳位點啊。
項目推不下去的時候，就借鑒別人的研究思路，為自己的項目錦上添花。