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GeneATLAS的數據全部來自 UK Biobank 的452,264個英國白人樣本。
總共囊括的表型有778個，位點有三千萬個。
優點
網站所有關聯分析的summary數據都是可以下載的。
而且提供了所有表型的原始基因型數據的曼哈頓圖、imputation的曼哈段圖、Q-Q Plot
可以說是相當貼心了。
缺點
不能下載原始基因型數據。
樣本是歐洲群體，可能某些結果在其他群體有差異。
這個網站可以下載什么
1. 下載表型數據
比如搜索肥胖表型，會出現如下界面：
Manhattan Plot (genotyped)：
Manhattan Plot (imputed)：
Q-Q Plot：
此外，還提供了計算這個表型所用的樣本信息。
比如case有多少例，control多少例。
男性和女性是否都納入分析。
2. 下載一個或多個variants數據
見 search 欄的 by variants
3. 下載一段區域或者基因數據
見 search 欄的 by Region or Gene
4. 下載一個SNP位點的Phewas數據
見 search 欄的 Phewas
這個Phewas的意思是通過輸入一個SNP位點，網站會返回這個SNP位點的所有表型的關聯分析數據。
5. 下載一段區域的Phewas數據
見 search 欄的 Region Phewas
意思同4，只不過這個選項是搜索一段區域。
6. 通過P值的閾值篩選，下載數據
見 search 欄的 By significance
好了，今天就講到這里，趕快試一下吧，難道你不好奇你研究的遺傳位點/基因對700多個表型有沒有貢獻嗎，又或者你研究的表型的遺傳位點是什么？
試試，又花不了多少時間。
GeneATLAS網站在這：
http://geneatlas.roslin.ed.ac.uk/
此篇文章感謝bio生物信息群成員王靜小伙伴提供的信息。