斷斷續續使用simpleitk處理CT和X光圖片有些時間了，但是學的知識都比較零散，沒有形成系統的概念，於是對着SimpleITK的英文文檔https://simpleitk.readthedocs.io/en/master/index.html學習一遍，再結合自己的一點經驗，做一點總結。
SimpleITK是ITK的簡化接口，使用起來更加方便，有多種語言接口，我平時用的都是python版，安裝比較簡單，pip install SimpleITK即可
SimpleITK是專門處理醫學影像的軟件，在SimpleITK中，圖像的概念與我們在計算機視覺中常用的RGB圖像差異很大，后者只是一個多維矩陣，是一個數學上的概念，而在SimpleITK中，圖像是一種物理實體，圖像中的每一個像素都是物理空間中的一個點，不光有着像素值，還有着坐標，間距，方向等概念
下圖是一個直觀的解釋
size：圖像在各維度的像素個數
spacing：圖像各維度上像素之間的距離（物理層面的，有單位，一般為mm)
physical extent：圖像在物理空間中的大小
Origin：圖像原點的坐標（物理層面的，有單位，一般為mm，與spacing保持一致）
direction：采用方向余弦矩陣，也就是圖像自身坐標系相對於世界坐標系（固定不動的）的角度，再直白點就是新坐標系在原坐標系上各個方向的投影，百度百科https://baike.baidu.com/item/方向余弦
為了強調此處的圖像不僅僅是一個數字組成的矩陣，用圖說話
兩幅圖的內容能看出來是一樣的，但是像素間距不同
再看
兩幅圖內容一樣，但是方向和坐標原點都不同，在SimpleITK中是不同的圖像