3D Slicer中文教程(二)—軟件功能界面介紹


1.界面介紹

 

2.菜單及工具欄介紹

(1)菜單

File-文件菜單

文件菜單包含用於加載MRML場景的選項,用於從互聯網下載樣本數據集或各種類型的各個數據集。此處還提供了保存場景和數據的選項。

Edit-編輯菜單

包含一個提升應用程序設置界面的選項。此界面允許用戶自定義其Slicer的安裝。 “編輯 - >應用程序設置”可用於包含或禁止各種模塊,自定義Python Interactor的外觀,選擇自定義字體,指定臨時目錄以及完成其他自定義。此外,還包含復制、粘貼,截切功能

View-查看菜單

此菜單包含提高Python Interactor和錯誤日志的選項,這兩個有用的開發人員工具。選項可以切換布局,還可以在“視圖”菜單下提供單個工具欄和模塊GUI面板的顯示。

Help-幫助文件

常用幫助文件及關於軟件的信息

(2)工具欄

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加載和保存選項

加載場景選項將引發瀏覽器選擇並加載數據集合作為MRML場景。此選項將清除現有場景並重置應用程序狀態。 “保存”選項將引發“保存數據”界面,該界面提供了各種保存MRML場景和單個數據集的選項。

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模塊選擇和導航

“模塊選擇和導航”工具欄提供了用於搜索模塊名稱,從模塊菜單中進行選擇以及向后和向后移動模塊選擇歷史記錄的選項。

單擊搜索圖標並開始輸入將顯示並更新以相同字母開頭的模塊列表。

可以使用擴展管理器或更新其他模塊路徑應用程序設置來安裝其他模塊。

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核心模塊(又名收藏夾)

核心模塊工具欄提供了快捷方式,及一些Slicer的核心模塊,包括

Models

Transforms

Data

Volumes

Annotations

Interactive Editor

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布局、鼠標模式、視圖及十字線

布局部分可以選擇不停同的窗口顯示正在操作的數據,,常用的有four-Up和3D only

鼠標模式可以測距、標記ROI(region of interest)和基准

十字准線工具欄提供了一組選項,用於自定義跨所有切片查看器的十字准線的外觀和行為。

3.3D視圖及切片視圖左上角操作

1)3D 視圖控制

——通過鼠標在任何3D Viewer的左上角的推針圖標上訪問3D Viewer控制器。

——可以通過點擊有效地“引導”打開的推針圖標來持續打開面板。再次點擊“取消固定”面板。

——在推針旁邊,可以找到唯一的ID,將3D查看器與其他3D查看器區分開,當其他布局被選擇時可能已經創建。

——最后,有一個中心的視圖按鈕來設置虛擬相機,以顯示在此時在查看器中可見的所有內容。

——面板包含用於設置視點方向的選項,以及配置任何3D Viewer的外觀和行為。這包括將切片器設置為最遠的列中的搖滾或軌道的按鈕。眼睛圖標包含3D查看器中方向字母和邊界框可見性的控件。

——深度剝離是一種多通道技術,用於渲染半透明多邊形幾何而不排列多邊形。它可以用於解決半透明表面模型渲染問題。

2)切片視圖控制

——每個Slice Viewer支持三層:(前景或FG,背景或BG,標簽或L),可以單獨查看,或以可定制的方式混合在一起。當加載新的標量卷時,它會自動顯示在BG層。加載新的標簽貼圖時,會自動加載到L層。可以在任何Slice Viewer的控制面板中選擇性地更改這些圖層的內容。

——通過鼠標懸停在任何切片查看器左上角的推針圖標來訪問任何Slice Viewer的控制器。也可以通過單擊推針圖標來持續打開面板。在推針旁邊可以找到唯一的ID,區分特定的Slice Viewer與其他選擇了其他布局時可能創建的Slice Viewers。提供了一個切片滾動條,用於手動掃描切片,並且顯示屏右上方還提供了切片編號條目小部件,用於手動索引特定切片。每個Slice Viewer包含顯示每個圖層(前景,背景和標簽)的選項。對於前景和標簽圖層,可以通過使用旋轉框不透明小部件(下圖中的“不透明度”注釋指向)來控制圖層的不透明度。此外,標簽層的可見性可以在“輪廓”和“實體”模式之間切換(參見下圖中的“標簽輪廓”按鈕)。

——一些Slice Viewer配置選項可以通過使用Link選項應用於一個或所有Slice Viewers。當查看者取消關聯時,選項僅適用於正在調整的觀眾。觀看者鏈接時,該選項將適用於所有切片查看器。只有當與當前觀看者的交互完成后,觀眾鏈接的操作或交互的應用才被傳播到其他觀眾。例如,當觀看者鏈接時,在觀看者內放大將交互地縮放當前觀看者並且在交互完成時,縮放的效果將被傳播到其他觀看者。 Hot-Link設置會修改此行為,以便立即將所有觀眾應用互動的效果。鏈接和取消鏈接是持久設置。此處進一步介紹了Slice Viewer設置和交互的鏈接行為。

 

參考:

[1]https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly


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