PHI是一個致病菌的數據庫，截止到2017年8月1號為止，最新的版本是4.3，數據庫中收錄了實驗驗證過的致病菌的信息，其中有176個來自動物的致病菌，227個來自植物的致病菌，3個來自真菌的致病菌;
4.3版本中數據庫的具體信息如下：
共收錄了4775個基因， 相互作用有8610條， 致病菌有264種， 宿主有173種，疾病有428種，References 參考文獻有2330種
數據庫網址如下：
http://www.phi-base.org/index.jsp
在數據庫的記錄中，包含以下幾個比較常用的字段的信息：
GENE NAME : 基因名稱
HOSE SPECIES : 宿主的物種名稱
PATHOGEN SPECIES : 致病菌的名稱
DISEASE NAME : 疾病名稱
PHI-BASE ACCESSIONID : phi-base 數據庫的編號
PHENOTYPE MUTANT : 致病菌導致的表型變化
EXPERIMENTAL EVIDENCE : 實驗證據
MULTIPLE MUTATION :
以基因 AcpC 為例，進行檢索
在輸入框中輸入基因名稱，點擊SEARCH 按鈕，檢索出來的結果如下：
圖片左側的輸入框提供了不同的篩選項，可以根據Year等因素對結果進行進一步篩選，右側的表格是檢索出的最終結果
phi-base 是可以免費下載的，首先需要注冊一個賬號,點擊Download 按鈕會提示注冊賬號，注冊的過程就不詳細寫了，注冊完成之后就可以看到下載鏈接：
phi-base 提供了兩種下載方式：
第一種：下載fasta格式的序列，可以方便的用構建本地版的blast數據庫，對基因進行功能注釋
第二種：csv格式的整個數據庫，這種下載方式得到的信息更加全面
下載到的fasta部分內容如下：
>A0A023H5D8#PHI:6442#EepR#615#Serratia_marcescens#reduced_virulence MDNNHQKFDSQSIANRVRELFLHYGIGKRQHARELSRILDLSFSHAHRKLKGQSPWTLEQINSVAAALGETPAAIADLSAEHETTEPNMARDAIFFVAGVAMPCVGHIGDELPAGRPAEFVALRVEGQWHIYRADEAPAGPRYGV >A0A023NA98#PHI:3354#rtxA1#672#Vibrio_vulnificus#reduced_virulence MGKPFWRSVEYFFTGNYSADDGNNSIVAIGFGGEIHAYGGDDHVTVGSIGAKVYTGSGNDTVVGGSAYLRVEDTTGHLSVKGAAGYADINKSGDGNVSFAGAAGGVSIDHLGNHGDVNYGGAAAYNGITRKGLSGNVTFKGAGGY
可以看到為蛋白質序列，可以通過blastp對基因進行致病性的功能注釋
csv格式如下：
csv文件為整個數據庫的所有記錄，包含的字段很多，比較重要的還是之前的幾個字段；
參考資料 ： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16381911