miRTarBase 是一個手 收集的，經過實驗驗證過miRNA靶基因的數據庫，對於每條miRNA靶基因的記錄， 都會賦予1個唯一的 miRNA-target interactions （簡稱MTs） 編號，比如MIRT000012，目前miRTarBase 的版本為V7.0, 2017年9月15號更新，共收錄了23個物種。4076 個miRNA, 23054 個基因，422147 個靶基因相互作用。
網址：
http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php
miRTarBase 提供了多種檢索方式：
1） miRNA ID
2) Target Gene
3) Disease
4) Species
對於 Species, 分成了以下幾類：
1）Mammalia : 哺乳動物
Homo sapiens ：人
Mus musculus ： 小鼠
Rattus norvegicus ： 大鼠
Sus scrofa ： 豬
Ovis aries ： 羊
Cricetulus griseus ： 中國倉鼠
Bos taurus ： 奶牛
Canis familiaris ： 狗
2) Vertebrata ： 脊椎動物
Danio rerio ： 斑馬魚
Gallus gallus ： 雞
Oryzias latipes ： 青鱂
Taeniopygia guttata ：斑胸草雀
Xenopus laevis ： 非洲爪蟾
Xenopus tropicalis ：熱帶爪蟾
3）Nematoda : 線蟲
Caenorhabditis elegans ： 秀麗隱桿線蟲
4) Insect: 昆蟲
Bombyx mori ： 家蠶
Drosophila melanogaster ： 黑腹果蠅
5) Plants: 植物
Arabidopsis thaliana ：擬南芥
Oryza sativa ： 水稻
6) Viruses 病毒
Epstein Barr virus
Human cytomegalovirus
Kaposi sarcoma-associated herpesvirus
Vesicular stomatitis Indiana virus
根據Statistics , 可以看到每個物種 對應的miRNA 靶基因情況，
以 Human 為例， 共收錄了2599 個miRNA, 這些miRNA 的靶基因的集合共有15064 個，而人一共有2萬多個蛋白編碼基因，接近80%都受到miRNA的調控，可見 miRNA調控機制的廣泛性和重要性；
對於mINRA-Target Gene , 共有380639 條記錄， 平均每個miRNA 有 380639 / 2599 = 146 個靶基因， 而每個基因平均受到 380639 / 15064 = 25 個 miRNA的調控；
對於 每個miRNA 的靶基因結果，可以根據實驗證據的可靠性，進行篩選：
miRTarBase 的數據是可以直接下載的，在Download 頁面提供了多種下載方式。