DGE-seq和普通的transcriptomic profiling相比較有什么不同，有什么特點？
DGE就是用酶將mRNA切斷，只使用靠近poly A的一小段RNA去測序。
#1 由於不是測定mRNA的全長，DGE的數據量比轉錄組要小一些；
#2 DGE比轉錄組價格低一些；
#3 DGE和轉錄組都可以分析所有基因的表達豐度，並且比較組間基因表達差異；
#4 轉錄組還可以分析SNP、RNA editing、splicing、gene fusion等；而DGE不適宜做這些分析。
轉錄組測序和數字表達譜測序相比，主要有如下不同：
第一，測序目標不同。
轉錄組測序可以測定特定組織中全部 mRNA，而表達譜測序只是測定 mRNA的 36bp標簽序列；
第二，代表性不同。
數字表達譜測序只測定 36bp 標簽序列，而轉錄組測序測定轉錄本全長，因而可以更准確地代表樣品轉錄表達情況；
第三，應用范圍不同。
轉錄組測序應用范圍廣泛，不僅可以檢測表達量差異，而且可以發現新的轉錄本和可變剪切等。而表達譜測序只能粗略檢測表達量差異，不能反映基因轉錄表達的特點和規律；
第四，參考序列要求不同。
轉錄組測序不僅可以適用於基因組序列已知的物種，而且也適用於基因組序列未知的物種。而表達譜測序只適用於基因組序列已知的物種。
主要是看了一篇文章：
Identification and expression analysis of genes related to calyx persistence in Korla fragrant pear