本文主要介紹如何安裝和使用 sra-tools 這個軟件，主要用途還是把NGS序列原始數據從 sra 格式轉換到 fastq 格式，以便於后續的數據分析。
下載
SRA Toolkit
可以直接下載已經編譯過的軟件。無需自己再編譯。
文檔-安裝，使用
SRA Toolkit Documentation
SRA Toolkit Installation and Configuration Guide
GitHub-sra-tools
Building and Installing from Source
以下是個人簡單安裝使用
1.先下載已編譯軟件文件，解壓
2.然后設置PATH變量
export PATH=$PATH:/home/maque/sratoolkit.2.5.2-ubuntu64/bin
3.使用 fastq-dump 將sra 格式文件 轉換成 fastq 格式文件
fastq-dump --help
fastq-dump /media/文檔/ngs/SRR1956769.sra /media/文檔/ngs/
這樣生成的fastq文件就在 /media/文檔/ngs/ 文件夾中