今天用Matlab跑程序，由於數據量太大，又出現 Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.的問題。看到這篇文章非常實用，轉過來方便查閱~
用 Matlab 進行大規模科學計算或仿真時，內存是一個需要時常注意的問題。在matlab里運行
>>system_dependent memstats
就可以看到內存的使用狀況。當你寫的 Matlab 程序跳出“Out of Memory” 時，以下幾點措施是需要優先考慮的解決方法：
1. 升級內存
2. 升級64位系統
3. 增加虛擬內存
4. 采用3GB開關啟動系統
由於32位 Windows 操作系統的限制，每個進程只能使用最多 2GB 的虛擬內存地址空間，因此 Matlab 的可分配內存也受到相應的限制。Matlab 7.0.1 引進了新的內存管理機制，可以利用 Windows 的 3GB 開關，使用 3GB 開關啟動的 Windows 每個進程可以在多分配 1 GB 的虛擬地址空間。具體做法是：修改C盤根目錄 boot.ini 啟動選項加上 /3G，例如：
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /noexecute=optin /fastdetect /3G
5. 如果必有必要，不要啟動java虛擬機，采用matlab -nojvm啟動 （在快捷方式屬性里面的 "..../matlab.exe"） 改為（"...../matlab.exe" - nojvm）
6. 關閉Matlab Server
控制面板-管理工具-服務， 再找到matlabserver對應項，把啟動類型的自動改為手動即可
matlab server作為后台服務可以在其它機器上通過網絡調用此服務，進行計算任務。
7. Windows中字體、窗口等都是要占用系統資源的，所以在Matlab運行時盡量不要打開不用的窗口。
除此以外，更關鍵的是需要弄清楚以下幾個問題：
問題一：Matlab是如何存儲矩陣的？
Matlab中矩陣是以Block，也就是塊的形式存儲的。也就是說，當Matlab在為即將存儲的矩陣划分塊時，如果沒有相應大小的連續內存，即使實際內存沒有被完全使用，它還是會報告“Out of Memory”。
問題二：如何高效使用Memory？
Matlab 中數組必須占用連續分配的內存段，當無法為新建的數組分配連續的內存段的時候，”Out of Memory” 就會出現。在使用的過程中，由於存儲單元的不斷的被分配和清除，反復分配和釋放數組會使內存被分割成不連續的區域，可用的連續內存段減少，很容易造成 “Out of Memory”。因此當 Matlab 剛剛啟動時其連續內存最多，此時往往可以新建非常大的數組，這一點可以用命令 feature(’memstats’)（在 7.0 版本以上）看出。如果現實的最大連續內存段很小，但實際可用內存（非連續的）仍舊很多，則表明內存中碎片太多了。此時可以考慮用 pack 命令，pack 命令的作用就是將所有內存中的數組寫入硬盤，然后重新建立這些數組，以減少內存碎片。此外，在命令行或者程序中都可以使用 clear 命令，隨時減少不必要的內存。
因此，治本的方法如下：
1. 在命令行輸入 pack 整理內存空間
當內存被分為很多碎片以后，其實本身可能有很大的空間，只是沒有作構的連續空間即大的Block而已。如果此時Out of Memory，此時使用pack命令可以很好的解決此問題。
2. 使用稀疏矩陣或將矩陣轉化成稀疏形式 sparse
如果矩陣中有大量的0，最好存儲成稀疏形式。稀疏形式的矩陣使用內存更少，執行時間更短。例如：
000×1000的矩陣X，它2/3的元素為0，使用兩種存儲方法的比較：
Name
Size
Bytes
Class
X
1000x1000
8000000
double array
Y
1000x1000
4004000
double array (sparse)
3. 盡量避免產生大的瞬時變量，把沒必要的變量clear掉或當它們不用的時候應該及時clear。
4. 減少變量，盡量的重復使用變量（跟不用的clear掉一個意思）。
5. 把有用的變量先save，后clear 掉，需要時再讀出來。
下面介紹一下關於clear、save、load的特殊用法，這對在for或while等多重循環里出現out of memory非常有效。
for k = 1:N % N為循環次數
% ---------------------
var0 = k; % 獲得變量var0
%----------------------
string = [sprintf('var_%d', k) ' = var0;' ];
eval_r(string); % 等價於 var_k = var0;
save(sprintf('var_%d.mat', k), sprintf('var_%d')); % 等價於 save var_k.mat var_k
clear(sprintf('var_%d')); % 等價於 clear var_k
end
如果要讀取剛才存取的變量var_k, (k = 1,2, ..., N). 那么，可以使用如下用法：
for k = 1:N
load(sprintf('var_%d.mat', k)); % 等價於 load var_k.mat k = 1,2, ..., N
end
另外，還有一些非常有用的用法。如果用清除剛才讀取的變量 var_k, k = 1, 2, ..., N
clear '-regexp' '^var_' % 清除所有以“ var_ ”開頭的變量
還有很多關於save、clear、load等用法，具體help一下。
6. 使用單精度 single 短整數替代雙精度 double
Matlab 默認的數字類型是雙精度浮點數 (double)，每個雙浮點數占用 8 個字節。對於一些整數操作來說，使用雙浮點數顯得很浪費。在 Matlab 中可以在預先分配數組時指定使用的數字類型如以下命令：zero(10, 10, ‘uint8′) 。對於浮點數，在很多精度要求不高的情況下，可以使用4個字節的單浮點數 (single)，可以減少一半的內存。關於單、雙浮點數的精度對照如下，以便根據需要選擇使用：
single: 精度 (1.1921e-007) 最大數 (3.4028e+038)
double: 精度 (2.2204e-016) 最大數 (1.7977e+308)
7. 為矩陣變量預制內存而不是動態分配
在動態分配的過程中，由於開始Matlab所用的Block隨着矩陣的增大而連續的為此矩陣分配內存，但是由於Block的不連續性，很有可能最開始分配 的Block不能滿足存儲的需要，Matlab只好移動此Block以找到更大的Block來存儲，這樣在移動的過程中不但占用了大量的時間，而且很有可 能它找不到更大的塊，導致Out of Memory。而當你為矩陣變量預制內存時，Matlab會在計算開始前一次性找到最合適的Block，此時就不用為變量連續的分配內存。比較下面兩個程 序：
for k = 2:1000
x(k) = x(k-1) + 5;
end
x = zeros(1, 1000);
for k = 2:1000
x(k) = x(k-1) + 5;
end
顯然，第二個更好！！！最好的方法是，在程序一開始就位所有大的矩陣變量預制存存儲單元！！！
8. 盡量早的為大的矩陣變量預制內存
Matlab使用heap method管理內存。當在Matlab heap中沒有足夠的內存使用時，它會向系統請求內存。但是只要內存碎片可以存下當前的變量，Matlab會重新使用內存。比如：
a = rand(1e6,1);
b = rand(1e6,1);
使用大約15.4 MB RAM
c = rand(2.1e6,1);
使用近似16.4 MB RAM
a = rand(1e6,1);
b = rand(1e6,1);
clear
c = rand(2.1e6,1);
使用32.4 MB RAM
Matlab不能使用a、b被clear的空間，因為它們均小於2.1 MB，而同時它們也很可能是不連續的。最好的方法：
c = rand(2.1e6,1);
clear
a = rand(1e6,1);
b = rand(1e6,1);
使用16.4 MB RAM
9. 如果可行的話，將一個大的矩陣划分為幾個小的矩陣，這樣每一次使用的內存減少。
經過保存需要的變量，刪除不必要的變量，運行pack命令，系統前后的內存占用情況有了很大改善：
這是清理之前：
>> memory
Maximum possible array: 15 MB (1.622e+007 bytes) *
Memory available for all arrays: 194 MB (2.036e+008 bytes) **
Memory used by MATLAB: 1549 MB (1.624e+009 bytes)
Physical Memory (RAM): 4095 MB (4.294e+009 bytes)
* Limited by contiguous virtual address space available.
** Limited by virtual address space available.
這是清理之后：
Maximum possible array: 252 MB (2.641e+008 bytes) *
Memory available for all arrays: 988 MB (1.036e+009 bytes) **
Memory used by MATLAB: 762 MB (7.991e+008 bytes)
Physical Memory (RAM): 4095 MB (4.294e+009 bytes)
* Limited by contiguous virtual address space available.
** Limited by virtual address space available.
文章轉自：http://hi.baidu.com/flyingsnow0102/blog/item/98266c1955b512f5ae51331b.html