首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术 ...
首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因 如身高基因 表达水平高低的那些基因的位点。数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行定位,与连续变化的数量性状表型有密切关系表达数量性状基因座 expression Quantitat ...
2020-02-22 21:24 0 1400 推荐指数:
首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座:控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术 ...
目录 什么是eQTL?是通过哪些数据计算得来的,数据格式是什么? eQTL一般都富集在基因组的什么区域? 几个常见的eQTL数据库 什么是GTEx?目前第几版了?GTEx里面有哪些数据? GTEx有哪几篇里程碑文章? 大部分课题组是如何利用GTEx数据的? GTEx/eQTLGen ...
MatrixEQTL是一个快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具,被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库用于eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL进行eQTL mapping需要五个输入文件,即SNP.txt ...
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析属于Post-GWAS的一项重要工作,旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关的eQTL和mQTL位点。 传统的GWAS是将全基因组范围内的常见变异进行关联分析,鉴定与表型相关的基因座,但鉴定出来的位点大多数位于基因间隔区 ...
到底什么是eQTL? eQTL和QTL之间有什么联系?为什么说QTL比eQTL难很多? QTL和GWAS有什么关系? GTEx数据库里的eQTL数据如何利用? 说eQTL之前必须先解释QTL,QTL,一说到中文名就清楚了,数量性状位点,就是一个性状,比如身高,会由成百上千个基因来决定 ...
functional genomics | epigenomic annotations 刚入行的总是一头雾水,对这些表观的标记一点兴趣都没有,种类繁多,总是记不住,这里我就做一个常识性的总结,不搞 ...