对FPKM/RPKM以及TPM的理解 2018年07月03日 16:05:53 sixu_9days 阅读数：559 标签： FPKM/RPKMTPMRNA-Seq 更多 个人分类： RNA-Seq ...

注：这几个名词是RNA-Seq数据分析中的基础，在此小结一下。 在RNA-Seq的分析中，对基因或转录本的read counts数目进行标准化（normalization）是一个极其重要的步骤 ...

在分析了若干转录组之后发现，处理数据的时候最重要的不是技巧多么绚丽，你调包的能力有多么强。而是把基本的概念特别是统计和数学上的方法咬烂嚼吐，才是真正理解和掌握了分析数据的底层原理： 在RNA-Seq ...

TPM、read counts、RPKM/FPKM你选对了吗？ 已有 3940 次阅读 2017-12-15 15:04 |个人分类:RNA-seq|系统分类:科普集锦|关键词:RNA-seq| RNA-seq 本文转载自嘉因微信公众号，已获得授权。查看最新文章，敬请 ...

在转录组测序（RNA-Seq）中，基因的表达量是我们关注的重点。基因表达量的衡量指标有：RPKM、FPKM、TPM。 RPKM：Reads Per Kilobase Million；说实话，这个英文说明真的很费解，其实可以理解为“Reads Per Kilobase Per Million ...

之前不是很理解这两个概念，看了本文之后就差不多理解了。 基因组学技术专题（二）：为什么说FPKM/RPKM是错的 转自：安诺基因 我们都知道RNA-seq是通过NGS技术来检测基因表达量的测序方法。在衡量基因表达量方面，若是单纯以比对到参考基因的Reads个数（我们通常称之为Count值 ...

版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 这里我们跟Cufflinks的原理一致，使用总的外显子长度，并且去除过多的重叠的外显子的部分。使用R语言,输入为基因的GTF文件 包的安装 ...

的表现量，所以Ali Mortazavi等人在2008年提出以RPKM在估计基因的表现量。 RPKM是 ...