原文:StringTie

StringTie 参考链接:https: ccb.jhu.edu software stringtie index.shtml t manual input 参数简介 StringTie的基本用法: stringtie lt aligned reads.bam gt options 其中,aligned reads.bam 是输入文件,该输入文件要求必须按其基因组位置排序,如TopHat的输出文 ...

2017-12-04 15:35 0 7353 推荐指数:

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StringTie用法详解

StringTie 参考链接: https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml?t=manual#input https://www.cnblogs.com/adawong/articles/7977314.html ...

Tue Jan 15 22:31:00 CST 2019 0 6641
转录组组装软件stringtie

StringTie是約翰·霍普金斯大學计算机生物中心开发的一款转录组组装软件,在组装转录本的完整度,精度和速度方面都较以往的cufflinks 有很大的提升,也是目前有参考基因组转录组主流的组装软件。 软件的下载 StringTie 使用说明:新版本更新之后去掉了一些参数 ...

Wed Jun 19 01:23:00 CST 2019 0 501
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HISAT2+StringTie+Ballgown安装及使用流程 2015年Nature Methods上面发表了一款快速比对工具hisat,作为接替tophat和bowtie的比对工具,它具有更快的比对速度和更高的比对率,最近把这个流程走完一遍,感觉优势还是很明显的。 一、HISAT2 ...

Sat Nov 10 05:51:00 CST 2018 0 3946
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Sat Nov 10 05:38:00 CST 2018 0 3753
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Sat Nov 10 05:46:00 CST 2018 0 1422
 
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