用FastQC检查高通量测序原始数据的质量
本篇文章，主要参考了阳光1986的博文（http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367），自己测序的分析结果作为对比，加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后，第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http ...
原文：FastQC 测序质量
文章转载于Original Jolvii 生信百科 介绍一下如何理解 FastQC 各模块的结果 FastQC 的使用 FastQC的安装介绍请看这里。FastQC 支持 fastq gzip 压缩的 fastq SAM BAM 等格式，在不指定文件类型的情况下，FastQC 会根据文件的名字来推测文件的类型: 以 .sam 或者 .bam 结尾的文件会被当作 SAM BAM 文件来打开，并统计 ...
2017-07-15 22:05 0 1384 推荐指数：
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