BSA（Bulked Segregant Analysis）又称混合群体分离分析法，是利用极端性状进行功能基因挖掘的一种方法。主要思想是将两个具有极端性状的群体进行混池测序，比较两个群体在多态位点（SNP）的Allele Frequency（AF）是否具有显著差异。以植物株高性状为例，收集株高处于两个极端的样本分别混池测序，通过全基因组扫描，找到AF具有显著差异的位点，然后通过相关研究结果，对这些位点进行筛选，找到影响株高的功能位点。
BSA在1991年就被提出(Giovannoni et al., 1991; Michelmore et al., 1991)，只不过当时使用的标记不是SNP而是RAPD和RFLPs等传统标记。随着二代测序的发展，SNP标记的开发和测序成本的下降，使BSA技术成为QTL定位的有力工具。
最近在BSA技术上的出色工作，主要为日本Iwate Biotechnology Research Center的一个团队。他们开发出了MutMap（Abe, A. et al., 2012）、QTL-seq（Takagi, H. et al., 2013）、MutMap+（R Fekih et al., 2013）、MutMap-Gap（Takagi, H. et al., 2013）等。
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