Gromacs分子動力學模擬主要可以分為以下幾個步驟，不同的體系步驟可能略有不同。 在開始之前，先簡單了解一下預平衡： 分子動力學模擬的最終目的是對體系進行抽樣，然后計算體系的能量，各種化學鍵，成 ...

Martini粗粒化模型一開始就是為脂質開發的.（http://jerkwin.github.io/2016/11/03/Martini%E5%AE%9E%E4%BE%8B%E6%95%99%E7%A ...

mdp文件是能量最小化，NVT模擬，NPT模擬與MD模擬的必須文件。 mdp文件的詳細解釋可以參考官方文檔http://manual.gromacs.org/online/mdp_opt.html ...

1，下載安裝新版本的gcc（高版本的gcc只是推薦使用的，系統自帶的gcc4.4照樣能正常編譯、運行） 安裝完成后設置環境變量(/etc/profile)，需要重新登錄后才起作用。 ...