plink, vcftool計算等位基因頻率（allele frequency，vcf）
計算等位基因頻率有兩種方式，第一種用vcftool計算： /path/to/vcftools --vcf file.vcf --freq --chr 1 --out filefreq ...
原文：【種群歷史動態】評估方法SFS（Site/Allele Frequency Spectrum）
SFS解釋原文：joint SFS The G cat 參考博客：種群動態歷史評估方法之 SFS Site Allele Frequency Spectrum 簡書 jianshu.com 基因組數據統計可以總結數據集中等位基因的變異或分布，而無需我們所有樣品的整個基因序列。我們可以選擇一個非常有效的匯總統計量SFS 等位基因頻譜 ，這與等位基因頻率測量 如Fst 混淆，SFS本質上是某些等位基因 ...
2022-04-07 16:57 0 4068 推薦指數：
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