見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
最近做定量表達,使用了命令如下: bedtools coverage a all.bed b file.sort.bam gt file.coverage.txt 使用以上命令正常定量,但更多時候會出現Bus error或者Killed的報錯 能不能正常運行,很大程度上取決於系統的資源。 后來,經老師提醒,我可以加個 sorted參數,如下所示: bedtools coverage sorted ...
2022-02-14 21:12 0 1473 推薦指數:
見文章:Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...
featureCounts真的很厲害。 常見的參數(沒什么好說的,畢竟是固定的): -a -o input_file1 -F -t -g -Q -T 關鍵是以下幾個參數怎么設置: -f # Perform read counting at feature ...
這兩天有一個使用flink sql的實時流項目,需要在每個結果中標記當前時間。因為flink沒有獲取當前時間的函數,於是我自己定義了一個udf: 然后注冊成currentUnixTim ...
首先,常量表達式的概念:在編譯期就可以計算出結果的表達式 那么為什么要用常量表達式呢,用常量表達式會有什么好處: 1.允許一些計算只在編譯時進行一次,而不是每次程序運行時; 2.編譯器可以進行尺度更大的優化; 3.可以用在需求編譯期間常量的上下文,例如數組長度等; 使用 ...
原文地址:http://docs.oracle.com/javase/specs/jls/se8/html/jls-15.html#jls-15.28 這是我翻譯的,以備不時之用。 常量表達式是一個代表基本數據類型或者String數據類型的表達式,是在編譯期間能計算出來的值.由以下幾點 ...
正題 一般公司只是簡單分成 全量表,增量表,和拉鏈表。所以重點關注如下三個表就OK了。 全量表: ...
全量表:每天的所有寫最新狀態的數據 1、有無變化,都要報 2、每次上報的數據都是所有的數據(變化的+沒有變化的) 增量表:新增的數據 1、增量表,只報變化量,無變化不用報 拉鏈表: 1、記錄一個事物從開始,一直到當前狀態的所有變化的信息 2、拉鏈表每次上報的都是歷史記錄的最終狀態 ...
源代碼見文末 部分源代碼: ...