原文:QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (QIAGEN IPA) 軟件分析

IPA做得不錯,但是收費,這里分析一下這個軟件是怎么設計的,有哪些核心的數據和分析模塊。 軟件鏈接:QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis QIAGEN IPA 軟件價格: 萬美金 年,一個普通的研究所 學院,每年發 篇 分以上的paper,那每篇的成本就是 萬人民幣,太貴了。 國內目前也就 家買了,那每年的營收大概就是 萬美金,全球x ,那就是一年 萬美金的營收。 宣 ...

2021-12-23 12:31 0 3451 推薦指數:

查看詳情

pathway-pathway network 網絡分析

對於pathway 數據庫而言,我們最常見的就是利用KEGG 富集分析挖掘其中的信息,得到顯著富集的幾條通路; 對於代謝通路而言,不同的通路之間是會有相互關系的,比如在上游的通路中產生的代謝產物,進入下游的通路繼續發揮作用。 pathwaypathway 之間存在一個上下游的關系,所有 ...

Fri Feb 23 23:17:00 CST 2018 0 1317
軟件分析筆記:3.過程分析(Interprocedural Analysis)

本文是針對南京大學《軟件分析》譚添老師的視頻課的課堂筆記。 1.Motivation 此前我們討論的問題都是過程內的,也就是不涉及到方法調用。然而實際程序中方法調用屢見不鮮,繼續采用之前的分析方法會丟失精度,這也就是為什么我們需要過程(間)分析。二者的區別如下: 過程內分析 ...

Sat Apr 18 00:08:00 CST 2020 0 1577
Pathway富集分析氣泡圖

data.tsv > pathway = read.table("data.tsv",header = T, sep="\t") > library(ggplot2) > p = ggplot(pathway,aes(Pvalue,Pathway)) > ...

Tue Sep 19 00:07:00 CST 2017 0 5458
MAGMA——做gene analysis的GWAS數據分析軟件

目錄: overview download quick start 【Overview】 MAGMA是一個用於GWAS數據分析軟件,首次發表於文章: de Leeuw C, Mooij J, Heskes T, Posthuma D (2015 ...

Sun Oct 25 05:54:00 CST 2020 0 977
基因探針富集分析(GSEA)& GO & pathway

http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.html GO是Gene Ontology的簡稱,是生物學家為了衡量基因的功能而而發起的一個項目,從分 ...

Thu Aug 07 01:18:00 CST 2014 0 4301
smrt analysis 軟件安裝

pacbio 公司把三代測序常用軟件整合起來,做成了一個在線的分析軟件,類似於galaxy; 安裝過程如下,參考官網給的指導手冊 http://www.pacb.com/wp-content/uploads/2015/09 ...

Sat May 27 00:20:00 CST 2017 0 1921
生存分析(survival analysis)

一、生存分析(survival analysis)的定義  生存分析:對一個或多個非負隨機變量進行統計推斷,研究生存現象和響應時間數據及其統計規律的一門學科。   生存分析:既考慮結果又考慮生存時間的一種統計方法,並可充分利用截尾數據所提供的不完全信息,對生存時間的分布特征進行描述,對影響生存 ...

Tue Dec 06 17:48:00 CST 2016 0 50004
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM