原文:plink 閾性狀(質量性狀)GWAS分析

plink進行閾性狀 質量性狀 關聯分析有兩種方法 assoc 和 logistic, 這兩種方法又分別有分是否校正: assoc adjust 和 logistic adjust logistic方法有可以選擇是否添加協變量: logistic covar 和 logistic adjust covar 這么算的話一共有 種組合。 測試數據 assoc assoc adjust命令 logist ...

2021-12-17 23:47 0 1692 推薦指數:

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Rest(表述性狀態轉移)

本文的主要內容有: 1.了解Rest 2.了解RESTful WebService 3.使用SpringMvc實現RESTful ------------------------------我 ...

Fri Nov 04 02:58:00 CST 2016 1 1523
功能性狀的譜系信號與譜系獨立比較的分析方法-代碼分析

功能性狀的譜系保守性分析是架起進化歷程與生態過程的重要橋梁,是很多高階分析的基礎。譜系保守性是很多基於譜系的預測模型的基本前提,比如生態位模型、達爾文歸化假說、預適應假說。去除譜系保守性的影響,是跨物種進行性狀相關性分析的前提(側重於適應性的協同進化分析,而非系統發育分析)。 本次分享於2021 ...

Thu Apr 01 17:57:00 CST 2021 5 579
Genome-wide Complex Trait Analysis(GCTA)-全基因組復雜性狀分析

GCTA(全基因組復雜性狀分析)工具開發目的是針對復雜性狀的全基因組關聯分析,評估SNP解釋的表型方差所占的比例(該網站地址:http://cnsgenomics.com/software/gcta/)。目前GCTA工具可實現以下功能: 1 評估全基因組SNP的親緣關系(遺傳關系) 2 評估全 ...

Sat Oct 22 06:03:00 CST 2016 0 1416
第四章 數量性狀遺傳

第一講 數量性狀的概念與遺傳特點 一、質量性狀 1、質量性狀如貝殼顏色,豌豆花色,籽粒的飽滿程度等性狀(可以明顯發現) 2、表型之間截然不同,具有質的差別,用文字描述的性狀稱為質量性狀 3、在群體中呈間斷發布 二、數量性狀 1、如新生兒的身高體重,作物的產量,奶牛的泌乳量,棉花 ...

Thu Jun 24 22:50:00 CST 2021 0 180
SKU多維屬性狀態判斷算法

作者:周琪力,前端工程師,網絡常用昵稱「keelii」。在過去的4年里主要負責京東網站商品詳情頁的前端系統架構和開發,平時主要寫 JavaScript 偶爾寫點NodeJS,Python。琪力博客: ...

Mon Oct 15 19:56:00 CST 2018 0 1343
plink 進行PCA分析

當我們進行群體遺傳分析時,得到vcf后,可利用plink進行主成分(PCA)分析; 一、軟件安裝 二、使用流程 第一步:將vcf轉換為plink格式 上述會得到.map, .nosex和.ped結尾的三個文件。 第二步 ...

Sun Apr 26 22:00:00 CST 2020 0 3506
兩對等位基因控制一對相對性狀的規律(基因互作)

兩對等位基因控制一對相對性狀的規律(基因互作) 參考文檔:https://wenku.baidu.com/view/edf42b6682c4bb4cf7ec4afe04a1b0717fd5b3e1.html?from=search 基因互作是指幾對等位基因之間通過相互作用影響同一性狀 ...

Mon Jul 29 01:17:00 CST 2019 0 2579
 
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