原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=22492 原文出處:拓端數據部落公眾號 我們將使用葡萄酒數據集進行主成分分析。 數據 數據包含177個樣本和13個變量的數據框;vintages包含類標簽。這些數據是對生長在意大利同一地區但來自三個不同栽培品種的葡萄酒進行 ...
原文鏈接:http: tecdat.cn p 原文出處:拓端數據部落公眾號 可以使用環狀圖形展示基因數據比較。可以添加多種圖展信息,如熱圖 散點圖等。 本文目標: 可視化基因組數據 制作環形熱圖 環形熱圖很漂亮。可以通過R來實現環形熱圖。 首先,讓我們生成一個隨機矩陣,並將其隨機分成五組。 mat rbind cbind matrix rnorm , mean , nr , matrix rnor ...
2021-10-08 10:45 0 128 推薦指數:
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原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=20631 我們已經學習了如何處理混合效應模型。本文的重點是如何建立和可視化 混合效應模型的結果。 設置 本文使用數據集,用於探索草食動物種群對珊瑚覆蓋的影響。 knitr ...
2021年08月24日 更新 給每個exon編排序號,方便管理 cat gencode.v37.annotation.gtf | grep ENSG00000011304 | cut -f1 ...
原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=23509 原文出處:拓端數據部落公眾號 我們在研究工作中使用廣義加性模型(GAMs)。mgcv軟件包是一套優秀的軟件,可以為非常大的數據集指定、擬合和可視化GAMs。 這篇文章介紹一下廣義加性模型(GAMs)目前可以實現的功能 ...
原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=18770 為了用R來處理網絡數據,我們使用婚禮數據集。 > nflo=network(flo,directed=FALSE ...
原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=25122 原文出處:拓端數據部落公眾號 當一個序列遵循隨機游走模型時,就說它是非平穩的。我們可以通過對時間序列進行一階差分來對其進行平穩化,這將產生一個平穩序列,即零均值白噪聲序列。例如,股票的股價遵循隨機游走模型,收益序列(價格序列 ...
原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=23050 原文出處:拓端數據部落公眾號 在本文中,我們將用R語言對數據進行線性混合效應模型的擬合,然后可視化你的結果。 線性混合效應模型是在有隨機效應時使用的,隨機效應發生在對隨機抽樣的單位進行多次測量時。來自同一自然組的測量結果本身並不是 ...
原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=14601 如何使用蒙特卡洛模擬來推導隨機變量可能的分布,我們回到統計數據(無協變量)進行說明。我們假設觀察值是基礎隨機變量,具有未知分布的隨機變量。 這里有兩種策略。在經典統計中,我們使用概率定理來推導隨機變量的屬性在可能的情況下的分布 ...