一行命令批量修改染色體和位置為RS號
鑒於太多人問我怎么批量根據chr:pos查找RS號，在這里出一個教程。 注意以下教程展示的是修改hg19基因組版本的RS號，如果你的數據是其他版本的，請修改為對應版本的數據。 假定數據是test.txt，內容如下： 現在希望根據第一列chr:pos找到對應的RS號，實現 ...
原文：依據SNP染色體和位置信息批量轉換rs編號
如果只有SNP的染色體和物理位置信息，該如何批量轉換得到 rs ID 思路非常簡單，只需要下載 dbSNP 的參考文件，根據位置信息從參考文件中獲取對應的 rs 編號即可。 下面列舉兩個例子。 重命名 PLINK 文件 SNP 名字 第一個例子是 PLINK 格式的文件，要把 .bim 文件中的 SNP 名字改為 rs id。 首先從 UCSC 下載純文本格式的 dbSNP release 並解壓 ...
2021-09-14 11:42 0 208 推薦指數：
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