目錄 1.簡介 2.安裝與配置 3.分析流程 4.結果 1.簡介 PD全稱Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年 ...
外泌體 exosomes 是由哺乳動物細胞通過 內吞 融合 外排 等機制,主動向胞外釋放的納米級 直徑 nm 雙層囊泡小體,攜帶蛋白質 核酸 脂質等多種生物活性分子。越來越多的證據表明,外泌體是細胞間交流的重要媒介,它們可以將功能性分子轉移到受體細胞中,或參與受體細胞膜受體介導的信號傳導 。此外,由於外泌體在體液中很容易獲得,常作為非侵入性液體活檢的重要內容,以幫助識別疾病和評估治療反應。而外泌體 ...
2021-08-11 15:56 0 167 推薦指數:
目錄 1.簡介 2.安裝與配置 3.分析流程 4.結果 1.簡介 PD全稱Proteome Discoverer,是ThermoFisher在2008年 ...
目錄 1.簡介 2.下載安裝 3.配置與運行 4.結果 5.Perseus后處理 6.小結 1.簡介 2016年,德國馬普所的Cox和蛋白質組學領域巨擘Matthias Mann合作開發了MaxQuant軟件(MQ),並發表在nbt ...
目錄 1.簡介 2.安裝運行 3.結果 1.簡介 MSGF+也是近年來應用得比較多的蛋白鑒定軟件。java寫的,2008年初次發表JPR,2014年升級發表NC,免費開源,持續更新維護,良心軟件。而且,有研究者對不同蛋白質組學鑒定軟件進行比較分析 ...
1. 實驗設計與技術路線 (1) 常用流程 流程 說明 1.材料收集 細胞、細胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液...... 2.定量技術 蛋白組:iTRAQ/TMT ...
缺失值填充在數據分析領域的預處理過程繞不過去的一個坎,蛋白質組學也不例外,簡單記錄下,可能有些地方有其特殊之處。 分析缺失值來源:完全隨機缺失(MCAR,如質譜儀抖動,對數據影響無偏好性,均一分布),隨機缺失(MAR,依賴於其他觀測變量,如時間梯度越長采集越可能出現缺失值),非隨機缺失 ...
當前,關於高通量蛋白質組學的研究遠不如NGS這般火熱,網上關於這方面的知識也寥寥無幾,從事這一行也有一段時間了,但還沒好好總結過。加之過段時間可能要去做培訓,所以是時候把知識點總結一下,權當復習。當然整個蛋白質組學研究也算紛繁復雜,不可能面面俱到,而且很多東西我也在學習當中,肯定會出現不少紕漏 ...
從事基於質譜的蛋白質組學信息分析也有一年多時間了,回過頭來還是需要縷一縷這個領域的方方面面,溫故知新。 簡要概述 蛋白質組學(Proteomics)是研究一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質的統稱。作為系統生物學中的重要組成部分,處於中心法則下游,相比於基因組和轉錄組學而言,發展比較緩慢 ...
1. 外泌體研究背景: 胞外囊泡是從細胞膜上脫落或者由細胞分泌的具有雙層膜結構的囊泡狀小體,主要由微囊泡、凋亡小體、外泌體組成。而外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18 g/ml,可攜帶核酸、蛋白質質和脂質等,存在於血液、唾液、尿液等多種體液中 ...