HOMER | MEME | 轉錄因子的靶基因預測 | motif富集分析
轉錄因子motif是一些很短的模序（~10bp），在大基因組里很容易出現隨機比對，而且是以position weight matrix (PWM)格式來呈現，說明它的可變性，因此研究motif有哪些binding區域是沒有意義的，因為很難找到一個方法（閾值）來判斷真正的比對和隨機的比對 ...
原文：可變剪切調控因子motif基因富集分析 | motif enrichment | FIMO | MEME
類似篇：轉錄因子motif TSS區域富集分析 motif enrichment HOMER FIMO MEME 一個新的領域，現在我關注的是可變剪切調控因子，如PTBP ，它們有特定的RNA結合motif，類似TF。 相同點： 都是蛋白質的序列結合區域 有特定的序列motif 不同點： TF的motif主要結合在promoter和enhancer，負責基因轉錄 ASF的motif主要結合在gen ...
2021-08-08 23:12 0 215 推薦指數：
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