ChIP-seq | ATAC-seq | RNA-seq | 數據分析流程
補充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程，雖然可以完成任務，但是數據量一多，批次多起來，就非常難管理。 既然別人提供了這么好的流程，那就要用起來，管理起來不是一般的輕松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安裝比較麻煩，沒有針對local的一鍵安裝 ...
原文：Seq數據分析流程RNA
文章目錄 RNA seq 數據分析流程 相關軟件安裝 下載數據 sra轉fastq格式 數據質控 數據質控，過濾低質量reads，去接頭 比對 首先下載參考基因組及注釋文件，建立索引 比對 sam文件轉bam 為bam文件建立索引 reads的比對情況統計 計數 counts 差異基因分析 RNA seq 數據分析流程 相關軟件安裝 可以安裝 conda,在后續其他軟件安裝時非常好用。可自行百度進 ...
2021-07-06 18:14 0 216 推薦指數：
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