單細胞測序數據的差異表達分析方法總結
無論是傳統的多細胞轉錄組測序（bulk RNA-seq）還是單細胞轉錄組測序（scRNA-seq），差異表達分析（differential expression analysis）是比較兩組不同樣本基因表達異同的基本方法，可獲得一組樣本相對於另一組樣本表達顯著上調（up-regulated）和下調 ...
原文：分析帶UMI標簽的測序數據
分析帶UMI標簽的測序數據 條回復 分析帶UMI標簽的測序數據 檢測癌組織的低頻突變，為了提高檢測低頻突變的靈敏度，往往進行高深度的測序。但樣本之間存在交叉污染，測序有存在一定概率的錯誤，這些因素會導致高深度測序過程中將假陽性的信號放到，得到假陽性的結果。解決交叉污染的方法，有公司比如IDT采用唯一配對的樣本index，只有配對的index中的reads才屬於特定樣本。解決測序錯誤的方法，研究人 ...
2021-07-06 14:27 0 378 推薦指數：
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