初學生信——測序技術及其原理
參考： https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代測序 第二代高通量測序也稱為下一代測序技術，相比於第一代測序通量更高、速度更快、成本更低，主要有樣本制備、文庫構建、測序反應等過程。 一、常用概念 泳池（flowcell）：如圖所示，測序反應 ...
原文：初學生信——Base-calling（鹼基判讀技術）
參考：https: zhuanlan.zhihu.com p Base calling是一種算法 軟件 ：可以從row images 原始圖像 里通過計算機視覺的方式識別鹼基類型 DNA序列 ，將結果寫到cal文件里，最后幫助我們生成測序報告和FastQ數據。 Base Flourescence：熒光 signal detection：信號檢測 每一次保存圖像后，算法軟件會找到每一個DNB DNA ...
2021-06-02 10:31 0 1366 推薦指數：
相關推薦
初學生信——雙端測序原理
參考： https://zhuanlan.zhihu.com/p/61963366 一、目的 講解二代測序如何從很短的reads拼接為一個完整的基因組（雙端測序，如何對 paired-end 進 ...
初學生信——生物基本概念
1、ORF：開放閱讀框，開放閱讀框是基因序列的一部分，包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列，不能被終止子打斷。從起始密碼子開始，到終止密碼子結束。前面是5‘UTR， 后面是3’UTR，ORF一般是針對mRNA來說的。 mRNA由基因序列轉錄得來，一個基因可能有幾條不同的轉錄本，因而對 ...
四種不同的SNP calling算法call低鹼基覆蓋度測序數據時，SNVs數量的比較（Comparing a few SNP calling algorithms using low-coverage sequencing data）
摘要：如果不設置任何過濾標准的話，SOAPsnp會call出更多的SNVs；AtlasSNP2算法比較嚴格，因此call出來的SNVs數量是最少的，GATK 和 SAMtools call出來的數量位於SOAPsnp 和 Atlas-SNP2之間；四種calling算法的整體一致性是很低的，尤其在 ...
從零開始學生信-meme的使用
上一章講了meme的安裝，本章進行使用的講解，需要快捷食用本章節的請關注公眾號：生物信息分析學習 meme的使用，網上有很多例子。 1. 網頁版：快捷方便，一台電腦同時可以申請運行 ...
添加學生信息（連接數據庫初學）
主要功能有： 1登錄賬號：要求由6到12位字母、數字、下划線組成，只有字母可以開頭； 2登錄密碼：要求顯示“• ”或“*”表示輸入位數，密碼要求八位以上字母、數字組成。 3性別：要求用單選框或下 ...
JAVA初學練手項目，學生管理系統
github地址：https://github.com/qscqesze/StudentManager 簡單描述一下： UI層面用於接受用戶的處理信息，然后移交給StudentDao去處理數據。 ...
從零開始學生信-meme的安裝和使用
軟件：meme-suit 用途：鑒定motif 目的：其實我這里主要是為了使用streme模塊（因為sequence number超過50）。 辦法： 1. 如果只安裝meme，可以直接用co ...