參考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代測序 第二代高通量測序也稱為下一代測序技術,相比於第一代測序通量更高、速度更快、成本更低,主要有樣本制備、文庫構建、測序反應等過程。 一、常用概念 泳池(flowcell):如圖所示,測序反應 ...
參考: https: zhuanlan.zhihu.com p 一 目的 講解二代測序如何從很短的reads拼接為一個完整的基因組 雙端測序,如何對 paired end 進行拼接 二 單端測序 測序中最簡單的辦法,只有一種測序引物,使得PCR只能沿着這個引物的方向進行,所有的reads都只能按照一個方向進行讀取。但是這帶來了一些問題,以illumina為例,測序的質量會隨着測序的進行而下降,所以 ...
2021-06-02 10:00 0 2744 推薦指數:
參考: https://zhuanlan.zhihu.com/p/190757472 二代測序 第二代高通量測序也稱為下一代測序技術,相比於第一代測序通量更高、速度更快、成本更低,主要有樣本制備、文庫構建、測序反應等過程。 一、常用概念 泳池(flowcell):如圖所示,測序反應 ...
Roche 454,Solexa和ABI SOLID均有單端測序和雙端測序兩種方式。在基因組De Novo測序過程中,Roche454的單端測序讀長可以達到400p,經常用於基因組骨架的組裝,而Solexa和ABI SOLID雙端測序可以用於組裝scaffolds和填補gap。下面以solexa ...
1、ORF:開放閱讀框,開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列,不能被終止子打斷。從起始密碼子開始,到終止密碼子結束。前面是5‘UTR, 后面是3’UTR,ORF ...
參考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/340449764 Base calling是一種算法(軟件):可以從row images(原始圖像)里通過計算機視覺的方式識別鹼基類型(DNA序列),將結果寫到cal文件里,最后幫助我們生成測序報告和FastQ數據 ...
1、原理(馬達蛋白 納米孔蛋白 電阻膜) 1.1 馬達蛋白牽引DNA/RNA 與納米孔蛋白結合,因為薄膜兩端電勢差導致解鏈后的鏈可以通過納米孔。而通納米孔的鹼基因為結構和帶電的不同產生的電阻不同,導致電信號不同。最后通過basecalling的方法對原始的電信號解讀獲得鹼基。 1.2 ...
直接上代碼吧。 結果如下: 繼承關系是:deque => queue => collection=》Iterable 1.使用隊列的時候,new Link ...
ArrayDeque雙端隊列 使用&實現原理分析 學習Okhttp實現源碼時,發現其任務分發時用到了ArrayDeque。因此了解一下ArrayDeque的使用方式和實現原理。 一、Deque deque(double-ended queue)雙端隊列,是一種具有隊列和棧的性質 ...
From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 單細胞測序主要涉及單細胞基因組測序和轉錄組測序兩個方面,分別針對單細胞DNA及RNA進行序列分析和比較。單細胞測序一直是科學家關注的一個熱點。單細胞基因組測序目前主要有兩種擴增 ...