原文:使用FastqCount統計fastq文件基本信息?

目錄 . FastqCount簡介 . 使用 . 結果 . FastqCount簡介 快速實用小工具:FastqCount https: github.com zhimenggan FastqCount 統計指標包括: Total Reads Total Bases N Bases Q Q GC . 使用 壓縮文件可搭配pigz使用更香。 單個fastq .gz 文件: 多文件: . 結果 ...

2021-05-26 21:00 0 1015 推薦指數:

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統計 fastq 文件 q20 , GC 含量的軟件

二代測序的分析過程中,經常需要統計原始下機數據的數據量,看數據量是否符合要求;另外還需要統計q20,q30,GC含量等反應測序質量的指標; 在kseq.h 的基礎上稍加改造,就可以實現從fastq 文件統計這些指標的功能,而且速度非常的快 源代碼保存為 parse.c ...

Tue Feb 14 22:56:00 CST 2017 6 2483
Postgresql統計所有表的基本信息(如行數、大小等)

目錄 pg_class 記錄表和幾乎所有具有列或者像表的東西。這包括索引(但還要參見 pg_index )、序列、視圖、物化視圖、組合類型和TOAST表,參見 relkind 。下面,當我們提及所有這些類型的對象時我們使用“關系”。並非所有列對於所有關系類型都有 ...

Thu Sep 03 01:37:00 CST 2020 0 1434
sqlmap基本信息及參數使用方法

當給sqlmap這么一個url的時候,它會: 1、判斷可注入的參數 2、判斷可以用那種SQL注入技術來注入 3、識別出哪種數據庫 4、根據用戶選擇,讀取哪些數據 sqlmap支持五種不同的注 ...

Thu Jul 25 23:55:00 CST 2019 0 724
文件格式——fastq格式

fastQ格式 FASTQ是一種存儲了生物序列(通常是核酸序列)以及相應的質量評價的文本格式. 他們都是以ASCII編碼的。現在幾乎是高通量測序的標准格式。NCBI Short Read Archive也是這格式,多了一些描述性詞匯而已。 基本格式 包含四行,第一行由'@'開始,后面 ...

Wed May 03 19:36:00 CST 2017 0 1266
租戶的基本信息

CREATE TABLE `t_tenant` ( `tenant_id` varchar(40) NOT NULL DEFAULT 'c12dee54f652452b88142a0267ec74b7 ...

Thu Mar 05 23:20:00 CST 2020 1 673
Web Workers 的基本信息

問題:JavaScript 並行性 要將有趣的應用(例如從側重服務器端的實施)移植到客戶端 JavaScript,存在很多制約瓶頸。其中包括瀏覽器兼容性、靜態類型、可訪問性和性能。幸運的是,隨着瀏覽 ...

Fri Feb 07 18:13:00 CST 2014 2 2518
 
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