GWAS分析基本流程及分析思路
數據預處理（DNA genotyping、Quality control、Imputation） QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的工作用IMPUTE2完成 2. 表型數據統計分析 ...
原文：GWAS分析結果中pvalue/p.ajust為0時如何處理？
在GWAS分析的結果中，偶爾會遇到到pvalue為 的SNP位點，這時如果直接做曼哈頓或QQ圖，會出錯，因為log 無意義。 此時，該如何處理 如果你用的是Plink . 來做的GWAS，可加一個參數： output min p e ，即將小於 e 的pvalue都當成 e ， 也不例外。 如果你用的是其他軟件，手動將結果改動。可先用NA填充，再以最小值或更小值替換，如： 為何會出現pvalue為 ...
2021-05-04 21:43 0 976 推薦指數：
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