上位置為122-124范圍的位點 cat variants.vcf | java -jar Sn ...
目錄 需求 示例文件 代碼實現 補充說明 需求 客戶的一個簡單需求: 我有一批功能基因位點,想從重測序的群體材料中找到這些位點,如何批量快速獲得 示例文件 gene.txt test.vcf 代碼實現 run.sh 運行sh run.sh gene.txt test.vcf,或sh run.sh gene.txt test.vcf.gz 生成結果: 補充說明 以上代碼中利用了vcftools工具 ...
2021-03-13 23:04 0 1430 推薦指數:
上位置為122-124范圍的位點 cat variants.vcf | java -jar Sn ...
做群體變異檢測后,通常會有提取子集的操作,之前沒有發現bcftools有這個功能,都是自己寫腳本操作,數據量一上來,速度真的是讓人無語凝噎。這里記錄下提取子vcf文件的用法,軟件版本:bcftools-1.5 一、根據個體提取子集 根據樣品名提取vcf文件,准備要保留的個體名文件 ...
SNP是單核苷酸多態性,人的基因是相似的,有些位點上存在差異,這種某個位點的核苷酸差異就做單核苷酸多態性,它影響着生物的性狀,影響着對某些疾病的易感性。SNPedia是一個SNP調査百科,它引用各種已經發布的文章,或者數據庫信息對SNP位點進行描述,共享着人類基因組變異的信息。我們可以搜索 ...
最近采集了15萬張圖片,每天采集的圖片存儲在一個新的目錄下,在測試時需要從所有文件夾中隨機抽取圖片做測試。 ...
問題背景 假設我們有以下的測試程序: 這就是說,要我們實現一個給 string 類擴展一個 RemoveCharOf 方法,用以移除指定字符串所有出現在 chars 參數中的字符。這個擴展方法除了上例中用於獲得一個合法的文件名外,還可以有其他的用途。比如我最近一個項目中要把給定 ...
meQTL.pl matrix_meQTL.r readme.txt plot_boxplot.r ...
壓縮軟件呢!但這個壓縮軟件的強大之處在於,專門壓縮WORD和POWERPOINT文件,壓縮率高到嚇死人,最 ...
雖然說最近,有的提案其實2010年就存在了。基本上是firefox, webkit在推動。主要如下: calc: css3的函數,現在只有opera不支持。只要用於混合單位的計算,不能你手動轉換。這 ...