以Ezh2為例,徹底搞明白一個調控因子regulator的調控原理。 這個是一個非常典型的調控因子,廣泛涉及了epigenome, regulatome and transcriptome,這里還會加入miRNA,一旦把這個搞清楚了將會受益無窮。 Polycomb-group ...
前篇:EZH Ezh 組蛋白甲基化酶 組蛋白甲基轉移酶 關鍵調控因子 類似Ezh ,都是比較火爆的核心調控因子,與多種疾病和通路有關,可以搜到很多文章都圍繞它來講故事。 目的:鑒定出HDAC 激活和抑制的靶基因。 老套路: HDAC 上調,則其激活的target genes必然也會上調 既然是TF,那在promoter肯定有motif enrichment HDAC 上調,則其抑制的target ...
2021-03-17 20:46 0 302 推薦指數:
以Ezh2為例,徹底搞明白一個調控因子regulator的調控原理。 這個是一個非常典型的調控因子,廣泛涉及了epigenome, regulatome and transcriptome,這里還會加入miRNA,一旦把這個搞清楚了將會受益無窮。 Polycomb-group ...
類似之前的EZH2和HDAC1,但更復雜一點。 一些縮寫: RNA-binding proteins (RBPs)RNA-binding domains (RBDs) RNA recognition motif (RRM) hnRNP K-homology (KH ...
1. 組蛋白 “核小體”是染色體的基本結構單位。4種組蛋白,各2個組成一個8聚體,DNA鏈再 纏繞上去,就形成核小體了。每個組蛋白肽鏈都有氮端和碳端兩個“尾巴”,這些“尾巴”上的氨基酸可以被加上一些化學基團,即“修飾”。 2. 有哪些修飾?按照化學基團 ...
下表為常見的組蛋白修飾的主要分布及功能: 異染色質是染色質的濃縮,轉錄無活性狀態,H3K9甲基化是異染色質的標志。H3K27me1和H3K9me3存在於着絲粒異染色質區域 ...
參考資料: 1.醫學分子生物學 第六章 第一節 表觀遺傳學-甲基化 2.醫學分子生物學 第六章 第二節 表觀遺傳學-組蛋白修飾 3.組蛋白修飾是個啥 1.什么是表觀遺傳學? 舉個例子:同卵雙生的雙胞胎個體,從遺傳學角度說他們的DNA序列是一致的,但多種表型存在一些差異。經典的孟德爾遺傳定律 ...
類似篇:轉錄因子motif TSS區域富集分析 | motif enrichment | HOMER | FIMO | MEME 一個新的領域,現在我關注的是可變剪切調控因子,如PTBP1,它們有特定的RNA結合motif,類似TF。 相同點: 都是蛋白質的序列結合區域 ...
近年來,組蛋白翻譯后修飾(PTMs)因其能夠通過改變染色質結構進而調控基因轉錄和表達,在惡性轉化、腫瘤發生和進展中發揮重要作用 [1 ],已成為表觀遺傳研究熱點之一。目前發表的研究報道已鑒定到乳酸化、苯甲酰化、巴豆酰化等多種組蛋白翻譯后修飾類型,並對其開展了深入研究,極大的拓展了我們對表觀遺傳學 ...
針對特定應用,開發人員可通過調制擴頻因子、調制帶寬、糾錯編碼率這三個關鍵設計參數,對LoRa調制解調技術進行優化。 1、擴頻因子(SF) LoRa采用多個信息碼片來代表有效負載信息的每個位,擴頻信息的發送速度稱為符號速率(Rs),而碼片速率與標稱的Rs比值即為擴頻因子(SF ...