Fastqc使用說明
用FastQC檢查二代測序原始數據的質量 2013-01-28 21:28:10| 分類： Bioinformatics | 標簽：bioinformatics deep-seq |舉報 |字號大中小 訂閱 ...
原文：FastQC及MultiQC整合使用
FastQC FastQC 是一個基於Java寫的測序數據質量評估軟件。因為是用跨平台的語言Java寫的，自然而然FastQC應是可以在不同系統運行的了。不過也許大多時候我們還是在Linux服務器上用的多吧。 安裝 安裝軟件，方便的還是通過conda了，一行命令： 當然這需要你已經安裝了anaconda的前提下。 若沒有的安裝anaconda的話，可以選擇安裝anaconda 這更方便點 或者用使 ...
2021-01-24 19:06 0 580 推薦指數：
相關推薦
FastQC
1、下載fastqc wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 2、解壓 unzip fastqc ...
linux-ubuntu下fastQC的安裝及使用
1.fastqc是在Java環境下運行的；所以在安裝fastqc之前，Linux下要有相應的Java運行環境（JRE）.且java的版本應該在1.8.0版以上 2.java的安裝：下載最新版本的Java，注意要下載帶有JRE的版本。 3.解壓：tar -zxvf java.tar.gz ...
FastQC 的安裝
安裝 FastQC FastQC 下載 解壓 設置權限 加入到 PATH 測試 應該能看到幫助信息，說明已經安裝成功 ...
FastQC結果詳解
REF https://www.plob.org/article/5987.html 解壓后，查看html格式的結果報告。結果分為如下幾項： 結果分為綠色的"PASS"，黃色的"WARN"和 ...
FastQC 測序質量
文章轉載於 Original 2017-07-06 Jolvii 生信百科 介紹一下如何理解 FastQC 各模塊的結果 FastQC 的使用 FastQC的安裝介紹請看這里。FastQC 支持 fastq、gzip 壓縮的 fastq、SAM、BAM 等格式，在不指定文件 ...
fastqc出現錯誤
先用conda安裝 很順利 輸入 結果 可是輸入 這個網上說沒有圖形界面 可以這樣 或者 都可以 ...
測序數據質控-FastQC
通常我們下機得到的數據是raw reads，但是公司通常會質控一份給我們，所以到很多人手上就是clean data了。我們再次使用fastqc來進行測序數據質量查看以及結果分析。 fastqc的操作： 1. FastQC使用 fastqc -f [bam | sam | fastq ...