原文:代謝組學實驗、質控與分析

目錄 .實驗及質控 項目流程 非靶代謝質控 靶向代謝質控 代謝組全流程質控 .數據分析挖掘 代謝組分類回顧 數據預處理 定量層面挖掘 功能層面挖掘 .實驗及質控 項目流程 代謝組學分析的特點: 流程長 樣品量大,項目周期長 個體差異大 設備不穩定性 樣品復雜,基質效應顯著。 所以,質量控制是代謝組學研究基礎。 項目流程 樣本制備 質譜儀分析 數據預處理 定量及統計分析 定性分析 生信及后續分析 ...

2020-12-30 11:54 0 773 推薦指數:

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蛋白質實驗設計、質控分析

1. 實驗設計與技術路線 (1) 常用流程 流程 說明 1.材料收集 細胞、細胞上清、組織、血漿、血清、腦脊液、外泌體、尿液...... 2.定量技術 蛋白:iTRAQ/TMT ...

Thu Jan 16 05:19:00 CST 2020 0 2942
代謝】5.功能分析

目的 和轉錄或蛋白分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質:某個代謝通路在不同的狀態下(如疾病與健康)是否發生了顯著變化? ORA富集 回答的問題 ...

Thu Jan 16 05:54:00 CST 2020 0 1747
代謝】5.功能分析

目錄 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和轉錄或蛋白分析原理類似,目的是: 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路,方便解釋科學問題; 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物原理 ...

Wed Dec 30 19:52:00 CST 2020 0 429
代謝】3.數據分析

非靶向代謝實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機,開始十個QC,結尾三個QC,中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為:每行為一個m/z,每列為一個樣 ...

Mon Dec 30 06:35:00 CST 2019 0 5963
代謝】4.生物標志物分析

概念 生物標志物,即傳說中的biomarker,是一類可測量的,用來表征疾病狀態的物質,通常用於表征: 疾病的狀態(是否為某種疾病/某種亞型); 葯物敏感性,用於用葯指導; 生理狀態 ...

Fri Jan 03 06:35:00 CST 2020 0 3626
代謝】3.數據分析

目錄 非靶向代謝實驗設計 數據分析流程 1.數據預處理 2.數據質控 3.統計分析 非靶向代謝實驗設計 1.代謝物提取,一般要求每組至少10個樣; 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC; 3.QC樣本與實驗 ...

Wed Dec 30 19:49:00 CST 2020 0 1297
代謝】4.生物標志物分析

目錄 概念 類型 效果評價 多變量ROC分析 驗證 分析工具 概念 生物標志物,即傳說中的biomarker,是一類可測量的,用來表征疾病狀態的物質,通常用於表征: 疾病的狀態(是否為某種疾病/某種亞型); 葯物敏感性,用於用葯 ...

Wed Dec 30 19:51:00 CST 2020 0 619
代謝分析

綜述文章 標准數據 流程樣例 & 實用工具 MetaboAnalyst的多組學分析 代謝數據質量評估 主成分分析(PCA) PLS-DA/OPLS-DA二維圖 數據歸一化分析 ...

Tue Jun 08 00:34:00 CST 2021 0 993
 
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