【代謝組學】5.功能分析
目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似，目的是： 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路，方便解釋科學問題； 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質：某個代謝通路在不同的狀態下（如疾病與健康）是否發生了顯著變化？ ORA富集 回答的問題 ...
原文：【代謝組學】5.功能分析
目錄 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似，目的是： 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路，方便解釋科學問題 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理 過程。 富集分析方法 富集分析的本質：某個代謝通路在不同的狀態下 如疾病與健康 是否發生了顯著變化 ORA富集 回答的問題：一個代謝物集合 如某個代謝通路 中所包含的差異代謝物的數 ...
2020-12-30 11:52 0 429 推薦指數：
相關推薦
代謝組學實驗、質控與分析
（4）功能層面挖掘 1.實驗及質控 （1）項目流程 代謝組學分析的特點： ...
【代謝組學】3.數據分析
非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣； 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC； 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個QC，結尾三個QC，中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為：每行為一個m/z，每列為一個樣 ...
【代謝組學】4.生物標志物分析
概念 生物標志物，即傳說中的biomarker，是一類可測量的，用來表征疾病狀態的物質，通常用於表征： 疾病的狀態（是否為某種疾病/某種亞型）； 葯物敏感性，用於用葯指導； 生理狀態 ...
【代謝組學】3.數據分析
目錄 非靶向代謝組實驗設計 數據分析流程 1.數據預處理 2.數據質控 3.統計分析 非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣； 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC； 3.QC樣本與實驗 ...
【代謝組學】4.生物標志物分析
目錄 概念 類型 效果評價 多變量ROC分析 驗證 分析工具 概念 生物標志物，即傳說中的biomarker，是一類可測量的，用來表征疾病狀態的物質，通常用於表征： 疾病的狀態（是否為某種疾病/某種亞型）； 葯物敏感性，用於用葯 ...
代謝組學分析
綜述文章 標准數據 流程樣例 & 實用工具 MetaboAnalyst的多組學分析 代謝組學數據質量評估 主成分分析（PCA） PLS-DA/OPLS-DA二維圖 數據歸一化分析 ...
【代謝組學】1.代謝組學簡介
目錄 基本概念 代謝組學分類與應用 代謝組學研究意義與優勢 代謝組學分析流程 代謝組學常見名詞 基本概念 代謝物：所有分子量小於1500Da的小分子物質，包括糖類、核苷、有機酸、酮類化合物、多肽、氨基酸、有機胺類、醛類化合物、脂質、萜類、類固醇 ...