基本概念 代謝物：所有分子量小於1500Da的小分子物質，包括糖類、核苷、有機酸、酮類化合物、多肽、氨基酸、有機胺類、醛類化合物、脂質、萜類、類固醇、生物鹼、小分子葯物等等。 代謝組：一個細胞、組織、器官中所有代謝物的集合。 代謝組學：利用高通量的技術來鑒定和定量一個細胞、組織或器官中所有小 ...

目錄 代謝物的鑒定流程 從譜圖到峰表 代謝物的鑒定流程 蛋白組比基因組和轉錄組落后一檔次，代謝組學比蛋白組又落后一檔次，僅化合物的鑒定就讓人頭疼。 流程如下： 化合物精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定（篩選分子量相同的離子 ...

代謝物的鑒定流程 蛋白組比基因組和轉錄組落后一檔次，代謝組學比蛋白組又落后一檔次，僅化合物的鑒定就讓人頭疼。 流程如下： 化合物精確質量數 數據庫檢索 一級鑒定（篩選分子量相同的離子）。解決質量數問題。 一級鑒定（通過同位素分布比對，篩選分子量和元素組成相同的離子）。解決 ...

目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似，目的是： 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路，方便解釋科學問題； 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理/過程。 富集分析方法 富集分析的本質：某個代謝通路在不同的狀態下（如疾病與健康）是否發生了顯著變化？ ORA富集 回答的問題 ...

目錄 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和轉錄組或蛋白組的分析原理類似，目的是： 將大量的差異代謝物降維到少量的顯著富集的代謝通路，方便解釋科學問題； 從通路水平上可以更好解釋表型背后的生物學原理 ...

目錄 1.實驗及質控 （1）項目流程 （2）非靶代謝質控 （3）靶向代謝質控 （4）代謝組全流程質控 2.數據分析挖掘 （1）代謝組分類回顧 （2）數據預處理 （3）定量層面挖掘 ...

非靶向代謝組實驗設計 1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣； 2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC； 3.QC樣本與實驗樣本穿插上機，開始十個QC，結尾三個QC，中間每十個樣本穿插一個QC樣本 。 得到質譜譜圖數據經軟件處理后得到峰表。 峰表格式一般為：每行為一個m/z，每列為一個樣 ...

概念 生物標志物，即傳說中的biomarker，是一類可測量的，用來表征疾病狀態的物質，通常用於表征： 疾病的狀態（是否為某種疾病/某種亞型）； 葯物敏感性，用於用葯指導； 生理狀態 ...