GTF文件的全稱是gene transfer format，主要是對染色體上的基因進行標注。怎么理解呢，其實所謂的基因名，基因座等，都只是后來人們給一段DNA序列起的名字而已，還原到細胞中就是細胞核里面的一條長長的染色體（DNA序列）。而這個GTF文件的主要功能，就是指出我們所謂的基因在染色體 ...

我們在做生物分析的時候，經常會碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注釋文件。他們有着相似的名字，甚至連內容都極為相似~那么，他們究竟差在哪里呢？ GFF全稱為general feature format，這種格式主要是用來注釋基因組。 GTF全稱為gene transfer ...

工具推薦：https://github.com/openvax/gtfparse 真不敢相信，Linux自帶的命令會這么強大，從gtf中提取出需要的transcript，看起來復雜，其實一個grep就搞定了。 grep -F -f out.list gffcmp.combined.gtf ...

開發中,我們經常需要讀取本地文件(properties文件),這樣的好處是文件是動態的,可配置的.這時候我們就需要用到ResourceBundle這個類. 這個類屬於java.util.*. 這個類的好處: 輕松本地化並或者翻譯成不同的語言 博主理解:用locale可以選擇文件 ...

hg19有哪些染色體？ chr1 chr2 chr3 chr4 chr5 chr6 chr7 chr8 chr9 chr10 chr11 chr12 chr13 chr14 chr15 chr ...

我們生信技能書有一篇介紹bedtools的文章，可以在微信里搜着看下，非常有用。 bedtools 用法大全 http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf轉bed用Linux命令完全可以實現，因為gtf每一行比較規律，不像fasta和fastq ...

　　GTF文件的全稱是gene transfer format，主要是對染色體上的基因進行標注。怎么理解呢，其實所謂的基因名，基因座等，都只是后來人們給一段DNA序列起的名字而已，還原到細胞中就是細胞核里面的一條長長的染色體（DNA序列）。而這個GTF文件的主要功能，就是指出我們所謂的基因在染色體 ...

目錄 文件讀取 文件隊列構造 文件閱讀器 文件內容解碼器 開啟線程操作 管道讀端批處理 CSV文件讀取案例 先看下文件讀取以及讀取數據處理成張量結果的過程： 一般數據文件格式有文本、excel ...