rMATs是一款分析RNA可變剪切事件的軟件,其最大特點是考慮了replicate,還針對配對樣本(在醫學方面很多都是tumor和normal配對)建立了統計模型,如此以來,得到的結果相對來說也更好。具體可參考文獻《rMATS: Robust and flexible detection ...
問題 我在用rMATS turbo做可變剪切分析。然而運行程序發現輸出結果文件里只有表頭: 解決方法 這個問題在軟件github有幾個issues提到過類似問題,如 most output files with only a header 說可能是由參數 readLength設置得和實際的read長度不符導致的。加個參數 variable read length即可。 解決方法 根據測序數據正確設 ...
2020-11-10 21:55 0 425 推薦指數:
rMATs是一款分析RNA可變剪切事件的軟件,其最大特點是考慮了replicate,還針對配對樣本(在醫學方面很多都是tumor和normal配對)建立了統計模型,如此以來,得到的結果相對來說也更好。具體可參考文獻《rMATS: Robust and flexible detection ...
很簡單, 用excel做個合適的表頭,然后點擊“獲取字段”,則界面中獲得了整個表頭。 在這個界面中復制整個信息表,然后到 csv的輸入界面 把字段粘貼上,然后去掉“第一行包含表頭”的對勾即可 ...
) """ tf.csv是你當前目錄下的csv文件名, names后面是你想要設置的表頭內容 , ...
這個神奇的問題困擾了我半天,明明和我之前的寫入Excel方法幾乎一樣,以前可以,這次怎么都不成功,都是只有表頭沒有數據。 網上也找不到解決方法,反復測試之后終於解決這個坑爹問題,記錄一下。如果有人也遇到,可以參考。 直接說結論: 原因是我javabean上用到了@Data注解 ...
這個神奇的問題困擾了我半天,明明和我之前的寫入Excel方法幾乎一樣,以前可以,這次怎么都不成功,都是只有表頭沒有數據。 網上也找不到解決方法,反復測試之后終於解決這個坑爹問題,記錄一下。如果有人也遇到,可以參考。 直接說結論: 原因是我javabean上用到了@Data注解 ...
思路: 1.輸出表頭文件到指定目錄 2.bcp導出csv文件到temp目錄 3.將以上導出文件與表頭文件合並 4.刪除temp目錄下的文件 實現: 同理,bat實現與sh實現也一樣,我就不寫了 。 ...
注:這里說的大文件也不是太大,只有60多M而已(70多萬條數據),相對比較大而已。 為了減輕編輯的工作,某種情況下網站上可能用會到csv格式的文件進行數據導入,但一般網站除了有上傳文件大小限制以外,還有就是php腳本語言讀取文件到內存一些以及寫入到mysql中會超過最大范圍。因此只 ...
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