GSEABase | clusterProfiler | GSEA富集分析 | MSigDB
2023年09月01日 log2FC <- log2(rowMeans(TPM[,high.samples])+1) - log2(rowMeans(TPM[,low.sample ...
原文：clusterProfiler
clusterProfiler也是通過KEGG API去獲取物種對應的pathway注釋，對於已有pathway注釋的物種，我們只需要知道對應的三字母縮寫， clusterProfiler就會聯網自動獲取該物種的pathway注釋信息。 在clusterProfiler中，enrichKEGG KEGG通路 和enrichMKEGG KEGG模塊 支持下載最新的在線版本的KEGG數據進行富集分析。 ...
2020-11-01 21:53 0 525 推薦指數：
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