如何看懂火山圖 下面我們就說明下如何看懂和繪制火山圖。 標准的火山圖常用於展示顯著差異表達的基因,這里有兩個關鍵詞:顯著是指P<0.05,差異表達一般我們按照Fold Change ...
分析背景 火山圖常用於轉錄組研究中,也能應用於基因組,蛋白質組,代謝組等統計數據。它歸根到底是是散點圖的一種,它能將統計學中的統計顯著性量度 如p value,矯正后的P值 和變化幅度相結合,從而能夠幫助人們識別那些變化幅度較大且具有統計學意義的數據 如基因,蛋白等 ,如下圖所示。 圖形分解 圖中每一點代表所研究的基因,灰色的點代表這些基因在實驗組和對照組的表達情況不具有差異性,綠色和紅色的點代表 ...
2020-09-03 10:35 0 672 推薦指數:
如何看懂火山圖 下面我們就說明下如何看懂和繪制火山圖。 標准的火山圖常用於展示顯著差異表達的基因,這里有兩個關鍵詞:顯著是指P<0.05,差異表達一般我們按照Fold Change ...
標簽:RNA-seq;基因表達 一個非常常見的圖種,用於表示兩組數據基因表達差異的圖,通常橫縱坐標分別為 Log2FC 和 P-value。 畫出來並不難 美化稍微有點難度:標注重要的點,點的顏色、形狀、圖層順序。 基本數據准備: 帶log2FC ...
火山圖(Volcano Plot)常用於展示基因表達差異的分布,橫坐標常為Fold change(倍數),越偏離中心差異倍數越大;縱坐標為P值(P值),值越大差異越顯着。原因得名也許的英文因為查詢查詢結果圖像火山吧 一載入R函數包及數據集 library(ggplot2)data ...
火山圖 Volcano plot 在統計學上,火山圖是一種類型的散點圖,被用於在大數據中快速鑒定變化。由於它的形成像火山噴發的樣子,所以被稱為火山圖。和上文講的曼哈頓圖類似。 火山圖基本元素 火山圖也有很多種樣式,在生 ...
Differential gene expression analysis:差異表達基因分析 Differentially expressed gene (DEG):差異表達基因 Volcano Plot:火山圖 差異倍數(fold change) fold change翻譯過來 ...
火山手冊 環境搭建 下載火山開發軟件 www.lkuaiy.com http://voldp.com/ 安裝 第一個火山程序 概念和界面 概念 界面 界面事件和按鈕控件 界面事件 按鈕控件 按鈕事件 ...
抖音、西瓜視頻和火山小視頻都是字節跳動旗下的短視頻app,很多人不清楚為何字節跳動要做這么多款視頻類app,它們究竟是“同質化”程度過高? 還是差異化定位用戶群體?是內部互相競爭搶占市場還是共同開拓,占領更多的市場? 接下來我將帶着這些疑惑,逐一體驗這三個app並針對性的分析 ...
火山引擎雲產品發布會成功召開,正式宣布進軍雲市場 字節跳動正式對外發布火山引擎全系雲產品。12月2日,火山引擎「新雲·共未來」雲產品發布會在上海成功召開。這是火山引擎在升級為字節跳動企業級技術服務業務板塊之后,首次正式亮相並發布全系雲產品。 發布會上,字節跳動副總裁楊震原發表了題為《字節 ...