微生物測序樣本准備方法總結
在微生物測序中，樣本的准備從根本上是確保獲得高質量DNA的前提，而樣本准備也正是讓眾多微生物科研工作者感到困擾的重要一步。今天就給大家分類介紹一下常見的微生物樣本類型及采樣方法 微生物測序樣本准備方法 醫口樣本 ...
原文：微生物群落多樣性測序與功能分析
微生物群落多樣性測序與功能分析 .幾個概念： S rDNA 或 S rRNA OTU 測序區段。 . 測序區段：由於 S rDNA較長 . kb ，我們只能對其中經常變化的區域也就是可變區進行測序。 S rDNA包含有 個可變區，分別是v v 。一般我們對v v 雙可變區域進行擴增和測序，也有對v v 區進行擴增測序。 .工具 原料： . 樣本： S rDNA測序首先需要提取環境樣品的DNA，這些 ...
2020-08-30 23:12 0 734 推薦指數：
相關推薦
微生物組與代謝組關聯分析
://github.com/chentianlu 另外，想要代謝入門的同學可讀讀她寫的代謝組學數據分析綜述 ...
微生物+計算細胞倍增時間
TOP ## 1 簡介 雖然做生長曲線和求代際時間貌似是個很簡單常規的東西，可是到我一直不大確定自己求的對不對... 這次下定決心不再亂做... 不看解釋，跳到[作圖](#tag) ## 2 定義 ### 微生物 * 細菌，真菌 培養和測定 細菌：液體培養，不同的時間測定OD600 ...
微生物-細菌-葡萄球菌
細菌-葡萄球菌 葡萄球菌葡萄球菌是一群革蘭氏陽性球菌，因常堆聚成葡萄串狀，故名。多數為非致病菌，少數可導致疾病。葡萄球菌是最常見的化膿性球菌，是醫院交叉感染的重要來源，菌體直徑約0.8μm，小球形，但在液體培養基的幼期培養中，常常分散，細菌細胞單獨存在。葡萄球菌病主要是由金黃色葡萄球菌引起的家禽 ...
多樣性計算的各種距離
Beta多樣性和生態相似性 Beta多樣性（β多樣性，Beta diversity），即在一個梯度上從一個生境到另一個生境所發生的種的多樣性變化的速率和范圍，它是研究群落之間的種多度關系。Beta多樣性本身代表了一個復雜的問題，可以被視為物種更替（物種沿空間、時間或環境梯度的定向過程 ...
推薦系統多樣性
來自於：Joseph A. Konstan & John Riedl 推薦系統還有另外兩大特點，也對你最終看到的推薦結果有着顯著的影響：第一，在弄清楚你和其他購物者的相似度有多高之前 ...
集成學習多樣性的數學分析 —— 誤差分歧分解
1、集成學習背景 假定我們用個體學習器h1, h2, ..., hT通過加權平均法結合產生集成來完成回歸學習任務f：Rd => R： ...
微生物-細菌-敏感菌-溶血性鏈球菌
）在自然界中分布較廣，是一種常見的病原微生物，呈球形或橢圓形，直徑0.6-1.0μm，呈鏈狀排列，長短 ...