bwa的安裝流程安裝本軟體總共需要完成以下兩個軟體的安裝工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安裝a.下載BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安裝BWA ...
官網: https: github.com samtools samtools https: github.com samtools samtools releases https: github.com samtools samtools blob develop INSTALL 安裝: wget https: github.com samtools samtools releases down ...
2020-08-29 21:10 0 1779 推薦指數:
bwa的安裝流程安裝本軟體總共需要完成以下兩個軟體的安裝工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安裝a.下載BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安裝BWA ...
/Tutorial 安裝 由於 samtools 與 htslib , bcftools 經常結合使用,因此, ...
功能如下: 1、View 主要功能講sam文件轉位bam文件。 涉及的參數: -b 輸出bam格式。。默認是sam文件 -h 輸出的sam文件帶header。。默認不 ...
轉自:http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一個用於操作sam和bam文件的工具合集。包含有許多命令。以下是常用命令的介紹 1. view view命令的主要功能是:將sam文件轉換成bam文件;然后對bam文件進行 ...
第一次在Linux上不用root權限安裝軟件,查看了很多博客,並實踐安裝成功。大致總結了一下samtools的安裝過程,僅供大家參考,如有不對的地方,歡迎指正~ samtools安裝過程中依賴於lzma、htslib兩個包,所以在安裝samtools之前需要確保安裝了lzma、htslib ...
【怪毛匠子 整理】 samtools學習及使用范例,以及官方文檔詳解 #第一步:把sam文件轉換成bam文件,我們得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM ...
1、問題samtools安裝報錯 configure: error: libbzip2 development files not found 2、解決方法 ...
參考資料: SAMtools(官網) SAM Spec v1.4 (SAM格式 說明書) (重要) samtools-1.3.1 使用手冊 (SAMtools軟件說明書) samtools常用命令詳解(博客園) SAM格式定義(博耘生物) samtools使用 ...