原文:samtools 安裝使用

官網: https: github.com samtools samtools https: github.com samtools samtools releases https: github.com samtools samtools blob develop INSTALL 安裝: wget https: github.com samtools samtools releases down ...

2020-08-29 21:10 0 1779 推薦指數:

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linux下bwa和samtools安裝使用

bwa的安裝流程安裝本軟體總共需要完成以下兩個軟體的安裝工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安裝a.下載BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安裝BWA ...

Fri Mar 06 03:06:00 CST 2015 0 12620
samtools使用

/Tutorial 安裝 由於 samtools 與 htslib , bcftools 經常結合使用,因此, ...

Wed Sep 23 09:43:00 CST 2015 0 2096
samtools 使用簡述

功能如下: 1、View   主要功能講sam文件轉位bam文件。 涉及的參數:   -b 輸出bam格式。。默認是sam文件   -h 輸出的sam文件帶header。。默認不 ...

Fri Aug 03 05:59:00 CST 2018 0 2743
samtools和bcftools使用說明

轉自:http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一個用於操作sam和bam文件的工具合集。包含有許多命令。以下是常用命令的介紹 1. view view命令的主要功能是:將sam文件轉換成bam文件;然后對bam文件進行 ...

Tue May 16 02:31:00 CST 2017 0 5153
Samtools在Linux上非root權限的安裝

第一次在Linux上不用root權限安裝軟件,查看了很多博客,並實踐安裝成功。大致總結了一下samtools安裝過程,僅供大家參考,如有不對的地方,歡迎指正~ samtools安裝過程中依賴於lzma、htslib兩個包,所以在安裝samtools之前需要確保安裝了lzma、htslib ...

Fri Sep 08 02:51:00 CST 2017 19 3170
SAMTOOLS使用 SAM BAM文件處理

【怪毛匠子 整理】 samtools學習及使用范例,以及官方文檔詳解 #第一步:把sam文件轉換成bam文件,我們得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM ...

Thu Dec 27 17:35:00 CST 2018 0 6697
SAM格式 及 比對工具之 samtools 使用方法

參考資料: SAMtools(官網) SAM Spec v1.4 (SAM格式 說明書) (重要) samtools-1.3.1 使用手冊 (SAMtools軟件說明書) samtools常用命令詳解(博客園) SAM格式定義(博耘生物) samtools使用 ...

Tue Jun 21 21:47:00 CST 2016 0 6887
 
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