原文:如何看懂火山圖

如何看懂火山圖 下面我們就說明下如何看懂和繪制火山圖。 標准的火山圖常用於展示顯著差異表達的基因,這里有兩個關鍵詞:顯著是指P lt . ,差異表達一般我們按照Fold Change 倍數變化 gt . 作為標准。 當我們拿到基因表達的P值和倍數后,為了用火山圖展示結果,一般需要把倍數進行Log 的轉化,比如某基因在實驗組表達水平是對照組的 倍,log ,同樣的如果是 ,也就是 . ,轉換后的結 ...

2020-08-12 21:46 0 612 推薦指數:

查看詳情

火山

分析背景     火山常用於轉錄組研究中,也能應用於基因組,蛋白質組,代謝組等統計數據。它歸根到底是是散點圖的一種,它能將統計學中的統計顯著性量度(如p value,矯正后的P值)和變化幅度相結合,從而能夠幫助人們識別那些變化幅度較大且具有統計學意義的數據(如基因,蛋白等),如下圖所示 ...

Thu Sep 03 18:35:00 CST 2020 0 672
繪圖技巧 - 火山 | volcano plot

標簽:RNA-seq;基因表達 一個非常常見的種,用於表示兩組數據基因表達差異的,通常橫縱坐標分別為 Log2FC 和 P-value。 畫出來並不難 美化稍微有點難度:標注重要的點,點的顏色、形狀、圖層順序。 基本數據准備: 帶log2FC ...

Fri Jan 08 00:19:00 CST 2021 0 413
GGPLOT2-plotly |讓你的火山“活”過來

火山(Volcano Plot)常用於展示基因表達差異的分布,橫坐標常為Fold change(倍數),越偏離中心差異倍數越大;縱坐標為P值(P值),值越大差異越顯着。原因得名也許的英文因為查詢查詢結果圖像火山吧 一載入R函數包及數據集 library(ggplot2)data ...

Fri Jul 26 05:49:00 CST 2019 0 1104
如何看懂時序

時序是一個IC器件的精華,看懂了時序,基本上就可以運用這個器件了。 傳送門:https://www.cnblogs.com/qsyll0916/p/7711098.html 操作時序永遠使用是任何一片IC芯片的最主要的內容。一個芯片的所有使用細節都會在它的官方器件手冊 ...

Sat Jan 29 23:50:00 CST 2022 0 2671
看懂16個英語時態

英語的時態由 4時: 現在時, 過去時, 將來時, 過去將來時; 4態: 一般 , 進行, 完成, 完成進行; 兩兩組合, 形成英語的 16 個時態. 動詞有, 原型, 過去式, ...

Thu Jul 19 00:11:00 CST 2018 2 8781
從IDEA角度來看懂UML

前言 我們目前已經學習了設計模式的7種設計原則。下面本該是直接進入具體的設計模式系列文章。 但是呢在我們學習設計模式之前我們還是有必要了解一下uml。因為后續的設計模式文章不出意外應該會很多地方使用到uml。如果你連uml都看不懂的話,那么學習起來肯定會有一定的難度。 所以說,這一 ...

Sat Aug 17 22:18:00 CST 2019 5 1186
帶你看懂什么是智慧城市

智慧城市就是運用信息和通信技術手段感測、分析、整合城市運行核心系統的各項關鍵信息,從而對包括民生、環保、公共安全、城市服務、工商業活動在內的各種需求做出智能響應。其實質是利用先進的信息技術 ...

Fri Dec 25 08:36:00 CST 2020 0 1011
fiddler 看懂瀑布Timeline

請求、接受數據等階段。把多個請求以時間作為 X 軸,用圖表的形式展現出來,就形成了瀑布。在 Fidd ...

Tue Oct 16 21:09:00 CST 2018 0 1042
 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM