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一 假設檢驗 假設檢驗的基本思路是: 設立零假設 null hypothesis H ,以及與零假設H 相對應的非零假設 alternative hypothesis H ,在假設H 成立的前提下,計算出H 發生的概率,若H 的發生概率很低,基於小概率事件幾乎不可能發生,所以可以拒絕零假設。 科學研究一般會把我們希望得到的結論當作非零假設,而期望否定的結論當作零假設。只要我們證明零假設發生的概率很 ...
2020-08-02 21:06 0 699 推薦指數:
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來源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允許兩種FDR校驗。一個是voxel-wise FDR,另一個是topological ...
淺談多重檢驗校正FDR Posted: 四月 12, 2017 Under: Basic By Kai no Comments 例如,在我們對鑒定到的差異蛋白做GO功能注釋后,通常會計算一個p值。當某個蛋白的p值小於0.05(5%)時,我們通常認為這個蛋白在兩個樣本中的表達 ...
matlab自帶函數mafdr,當ttest數較多時,可直接用[FDR, Q]=mafdr(P);但是Storey procedure在p值少於1000個時會崩潰,此時應改用BH FDR方法:mafdr(P,'BHFDR', true)。該方法對於少量ttest更穩健,但是更保守。 參考 ...
總結起來就三句話: (1)當同一個數據集有n次(n>=2)假設檢驗時,要做多重假設檢驗校正 (2)對於Bonferroni校正,是將p-value的cutoff除以n做校正,這樣差異基因篩選的p-value cutoff就更小了,從而使得結果更加嚴謹 (3)FDR校正是對每個 ...
差異表達分析之FDR 隨着測序成本的不斷降低,轉錄組測序分析已逐漸成為一種很常用的分析手段。但對於轉錄組分析當中的一些概念,很多人還不是很清楚。今天,小編就來談談在轉錄組分析中,經常會遇到的一個概念FDR,那什么是FDR?為什么要用FDR呢?一起來學習吧! 什么是FDR ...
p值還是 FDR ? 差異分析 如何篩選顯著性差異基因,p value, FDR 如何選 經常有同學詢問如何篩選差異的基因(蛋白)。已經計算了表達量和p value值,差異的基因(蛋白)太多了,如何篩選。其中最為關鍵的是需要對p value進行校正 ...
http://www.360doc.com/content/18/1007/19/51784026_792756866.shtml ...