NCBI原始數據下載by Aspera Connect
主要參考這篇文章： http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=2651154488&idx=1&sn=e693 ...
原文：使用Aspera (ascp 命令)從NCBI高速下載數據
. 簡介 生物信息研究人員往往需要從NCBI sra 或者EBI ENA下載高通量的測序數據。而通過NCBI申請獲得的數據往往需要通過Aspeara進行下載。 . Aspeara 安裝 wget http: d gcli yxqn z.cloudfront.net connect bin aspera connect . . . linux .tar.gz tar zxf aspera conn ...
2020-07-23 17:40 0 2770 推薦指數：
相關推薦
github高速下載的方法
windows修改host文件： C:\Windows\System32\drivers\etc\hostslinux 修改host文件： /etc/hosts 在文件后面加上這兩行 ...
國內高速下載Docker
一般情況下，我們可以從Docker官網下載docker安裝文件，但是官方網站由於眾所周知的原因，不是訪問慢，就是下載慢。下載docker安裝包動不動就要個把小時，真是極大的影響工作效率。 在這里推薦一個docker的下載（主要是Windows版）地址： https://oomake.com ...
使用sratoolkit下載NCBI數據
如何使用sratoolkit下載NCBI數據？ 比如我想下載這個研究的數據， 使用prefetch命令，輸入對應的SRA號碼 prefetch SRR10861695 默認下載限制是20G的數據，如果下載的數據較大，可以修改配置，比如改為最大100G prefetch --max-size ...
使用aspera從EBI下載fastq數據
前面我們大量NGS相關教程視頻免費發布在B站，都是使用NCBI的SRA數據庫下載sra文件后轉為fastq進行NGS分析流程，其實是因為我本人一直不在中國大陸，所以沒有網絡問題。但是學生們不一樣，同樣的命令他們prefetch的下載比蝸牛還慢，即使加上aspera后也會面臨sra文件轉為 ...
2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera從NCBI的SRA數據庫中下載原始測序數據
目錄 1.Conda連接不上鏡像源問題 2. aspera不能再獨立使用 3.使用prefetch搭配aspera 4. prefetch下載方法 記錄下下載過程，為自己和后人避坑。 1.Conda連接不上鏡像源問題 首先是anaconda安裝軟件 ...
Linux實現多線程高速下載
使用Wget下載，有時候速度挺慢的。 有沒有好辦法呢？ 一、解決方案 安裝axel 安裝方法： 二、其它安裝 也可以安裝yum-axelget插件，默認 yum使用單線程下載，安裝該插件后，會使用多線程下載。 ...
OneDrive高速下載鏈接分享
目錄 1. 按 2. 資源鏈接 3. 打賞&支持&聯系我 1. 按 建議不了解的先看下：OneDrive下載教程，以防出現莫名其妙的問題：如下載的文件打不開，無法正常訪問資源鏈接。 另外使用 ...